94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3661 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  682    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  40.65 
 
 
380 aa  200  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  39.68 
 
 
382 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  34.33 
 
 
361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  32.83 
 
 
342 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  35.09 
 
 
318 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  35.09 
 
 
318 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  35.09 
 
 
318 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  33.33 
 
 
330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  29.89 
 
 
367 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  32.34 
 
 
323 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  33.03 
 
 
330 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  33.03 
 
 
330 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  32.7 
 
 
331 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  32.67 
 
 
330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  32.67 
 
 
330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  32.67 
 
 
330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  31.52 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  31.61 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  34.05 
 
 
328 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  33.13 
 
 
324 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  30.21 
 
 
335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  30.21 
 
 
335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  30.75 
 
 
330 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  33.65 
 
 
343 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  29.91 
 
 
335 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  28.66 
 
 
331 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  32.12 
 
 
318 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  33.85 
 
 
325 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  31.94 
 
 
332 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  32.17 
 
 
330 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  32.17 
 
 
333 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  29.53 
 
 
335 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  30.96 
 
 
375 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  32.05 
 
 
332 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  31.08 
 
 
376 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  30.77 
 
 
377 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  31.21 
 
 
327 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13147  hypothetical protein  28.39 
 
 
344 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.825621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  31.29 
 
 
343 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4359  hypothetical protein  30.33 
 
 
325 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4128  hypothetical protein  30.33 
 
 
325 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  29.97 
 
 
329 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4203  hypothetical protein  30.33 
 
 
325 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  29.46 
 
 
343 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  29.52 
 
 
332 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  29.91 
 
 
343 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  29.88 
 
 
343 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  30.82 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  27.68 
 
 
380 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  29.88 
 
 
343 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  29.48 
 
 
343 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  29.48 
 
 
343 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  29.48 
 
 
343 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  31.08 
 
 
324 aa  92.8  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  29.88 
 
 
343 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  32.43 
 
 
315 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  27.03 
 
 
327 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  29.64 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  23.64 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  27.14 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  28.31 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  26.52 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  27.36 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  48.53 
 
 
349 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  29.39 
 
 
343 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  25.89 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1075  hypothetical protein  27.65 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1091  hypothetical protein  27.65 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.202469  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1102  hypothetical protein  27.65 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0127461  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  23.81 
 
 
372 aa  68.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  26.62 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  24.25 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  21.9 
 
 
330 aa  65.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  25 
 
 
359 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0168  hypothetical protein  37.65 
 
 
273 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  25.4 
 
 
392 aa  59.3  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22840  nitroreductase family protein  24.39 
 
 
326 aa  57  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0489  hypothetical protein  39.24 
 
 
271 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  23.77 
 
 
368 aa  56.6  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2624  hypothetical protein  36.47 
 
 
297 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130193  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2579  hypothetical protein  36.47 
 
 
279 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2618  hypothetical protein  36.47 
 
 
297 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  21.59 
 
 
377 aa  53.1  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  23.79 
 
 
384 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  21.9 
 
 
377 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  25 
 
 
730 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  22.96 
 
 
344 aa  50.8  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  23.3 
 
 
375 aa  47  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  35.29 
 
 
390 aa  46.2  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  30.95 
 
 
364 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  32.26 
 
 
378 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11385  hypothetical protein  25.56 
 
 
715 aa  43.5  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4376  hypothetical protein  26.38 
 
 
710 aa  43.1  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209188  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>