129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3591 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3591  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  100 
 
 		 945 aa  1919    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1584  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  53.59 
 
 		 199 aa  193  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0444  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  40.86 
 
 		 201 aa  118  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0734207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5299  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  42.17 
 
 		 194 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4672  sigma-70 region 2 domain-containing protein  40.11 
 
 		 203 aa  114  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2967  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  41.28 
 
 		 245 aa  108  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0309554  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0614  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.34 
 
 		 256 aa  101  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7410  hypothetical protein  28.48 
 
 		 375 aa  93.6  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2377  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24  35.09 
 
 		 180 aa  87  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0764696 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1634  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  35.63 
 
 		 182 aa  86.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2194  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.97 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  27.39 
 
 		 928 aa  84.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5413  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.76 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3039  sigma-70 region 2 domain-containing protein  32.57 
 
 		 198 aa  80.9  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5320  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.52 
 
 		 194 aa  80.9  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  28.88 
 
 		 915 aa  79.7  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2406  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.04 
 
 		 194 aa  80.1  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7061  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  34.3 
 
 		 190 aa  79  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1410  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.05 
 
 		 192 aa  75.9  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  27.73 
 
 		 790 aa  74.7  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1223  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.02 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3265  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.43 
 
 		 187 aa  73.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1238 aa  73.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1992  hypothetical protein  34.55 
 
 		 641 aa  72.8  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 850 aa  70.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  26.01 
 
 		 956 aa  68.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  25.48 
 
 		 664 aa  68.2  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  29.93 
 
 		 962 aa  67.4  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.62 
 
 		 991 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2102  hypothetical protein  35 
 
 		 485 aa  65.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6872  hypothetical protein  28.79 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  25.96 
 
 		 782 aa  64.7  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8946  hypothetical protein  29.27 
 
 		 351 aa  64.3  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00178879  normal  0.674352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  23.14 
 
 		 964 aa  63.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  26.69 
 
 		 967 aa  62  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  26.92 
 
 		 921 aa  61.6  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  31.45 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  23 
 
 		 1009 aa  60.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.06 
 
 		 2145 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  25.75 
 
 		 814 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 1060 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  24.58 
 
 		 946 aa  59.3  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  26.21 
 
 		 957 aa  59.3  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8929  hypothetical protein  25.71 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0590592  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  22.84 
 
 		 828 aa  58.9  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  24.59 
 
 		 985 aa  58.9  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  26.52 
 
 		 809 aa  57.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  25.68 
 
 		 368 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  27.83 
 
 		 775 aa  56.6  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2672  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.28 
 
 		 213 aa  57  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0964  hypothetical protein  27.56 
 
 		 443 aa  55.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  25.46 
 
 		 1025 aa  56.2  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  33.33 
 
 		 755 aa  55.5  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  23.97 
 
 		 965 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  27.56 
 
 		 1004 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 		 907 aa  53.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1050  hypothetical protein  38.1 
 
 		 664 aa  53.5  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.22 
 
 		 609 aa  52.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  24.28 
 
 		 689 aa  53.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  22.22 
 
 		 1147 aa  52.8  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  23.93 
 
 		 357 aa  52.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 1105 aa  52.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1550 aa  52.4  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  23.65 
 
 		 941 aa  52  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  24.83 
 
 		 1020 aa  52  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1039 aa  51.6  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 923 aa  52  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  25.1 
 
 		 965 aa  52  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0953  hypothetical protein  25.99 
 
 		 731 aa  51.6  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0922952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  25.63 
 
 		 1022 aa  51.6  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.35 
 
 		 1186 aa  51.6  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 465 aa  51.6  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  24.55 
 
 		 992 aa  51.2  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  32.05 
 
 		 1054 aa  51.2  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  25.31 
 
 		 1266 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 1261 aa  50.8  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  24.18 
 
 		 907 aa  50.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 843 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3430  hypothetical protein  28.7 
 
 		 296 aa  51.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 		 1600 aa  49.7  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  26.72 
 
 		 908 aa  49.7  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  23.36 
 
 		 806 aa  49.3  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  48.9  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1996  hypothetical protein  31.58 
 
 		 647 aa  49.3  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0882712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  25.81 
 
 		 928 aa  49.3  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  22.3 
 
 		 981 aa  48.9  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1439  Ion transport 2 domain protein  32.5 
 
 		 521 aa  48.9  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1181  hypothetical protein  28.28 
 
 		 295 aa  48.9  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.96487  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 945 aa  48.5  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  22.92 
 
 		 941 aa  48.5  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  26.39 
 
 		 993 aa  48.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  27.59 
 
 		 838 aa  48.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  24.57 
 
 		 934 aa  48.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  26.27 
 
 		 490 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  20.93 
 
 		 438 aa  47.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 949 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 542 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1073  hypothetical protein  25 
 
 		 464 aa  47.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  25.64 
 
 		 1008 aa  47.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3283  hypothetical protein  28.57 
 
 		 475 aa  47.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>