85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3535 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3535  Cholesterol oxidase  100 
 
 
533 aa  1092    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30650  choline dehydrogenase-like flavoprotein  59.08 
 
 
534 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104777  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  53.04 
 
 
543 aa  548  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  52 
 
 
547 aa  538  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  48.88 
 
 
546 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  46.88 
 
 
534 aa  488  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  38.27 
 
 
543 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  35.47 
 
 
544 aa  252  9.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  34.98 
 
 
538 aa  250  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  34.77 
 
 
513 aa  244  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  33.33 
 
 
530 aa  240  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  34.2 
 
 
541 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  31.67 
 
 
502 aa  233  5e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2810  cholesterol oxidase  37.01 
 
 
543 aa  217  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 
657 aa  94.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.68 
 
 
556 aa  92  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 
591 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 
591 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 
591 aa  90.1  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  24.2 
 
 
554 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  23.88 
 
 
551 aa  87  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.35 
 
 
535 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 
540 aa  83.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  27.7 
 
 
889 aa  83.6  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  29.54 
 
 
578 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.62 
 
 
557 aa  80.1  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 
578 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
547 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  28.61 
 
 
533 aa  76.6  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  28.92 
 
 
578 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.69 
 
 
543 aa  73.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  28.66 
 
 
569 aa  73.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.69 
 
 
543 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.07 
 
 
786 aa  72.4  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  26.27 
 
 
696 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.85 
 
 
550 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.48 
 
 
1132 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.6 
 
 
1150 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.01 
 
 
593 aa  68.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  26.33 
 
 
632 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  26.33 
 
 
632 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  26.33 
 
 
653 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  26.33 
 
 
632 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  26.33 
 
 
632 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  26.33 
 
 
552 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  26.33 
 
 
632 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.63 
 
 
623 aa  67.4  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 
577 aa  67  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.75 
 
 
1152 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.39 
 
 
567 aa  65.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 
587 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.22 
 
 
572 aa  64.7  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3364  hypothetical protein  22.74 
 
 
738 aa  63.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451115  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 
564 aa  63.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.24 
 
 
583 aa  62  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.21 
 
 
570 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  25.79 
 
 
622 aa  60.8  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.88 
 
 
537 aa  60.5  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  45.71 
 
 
1152 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 
489 aa  58.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  28.66 
 
 
563 aa  58.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  25.96 
 
 
1150 aa  57.8  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
556 aa  54.7  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.31 
 
 
552 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.28 
 
 
586 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  46.55 
 
 
567 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  46.55 
 
 
577 aa  51.2  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  48.28 
 
 
581 aa  51.6  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45 
 
 
546 aa  50.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0672  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40 
 
 
532 aa  50.8  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.482202  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07267  conserved hypothetical protein  28.23 
 
 
549 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.534506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3885  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.82 
 
 
657 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0361695  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  22.36 
 
 
526 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  43.1 
 
 
563 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2044  GMC family oxidoreductase  24.45 
 
 
494 aa  47.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.27 
 
 
562 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.61 
 
 
582 aa  47  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.86 
 
 
565 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  29.09 
 
 
512 aa  45.1  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  43.55 
 
 
562 aa  45.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3863  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.33 
 
 
531 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0591  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.88 
 
 
529 aa  45.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.559544 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05037  conserved hypothetical protein  25.69 
 
 
1146 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.1 
 
 
520 aa  44.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0857  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.36 
 
 
531 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>