More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3513 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  100 
 
 		 541 aa  1077    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  57.17 
 
 		 571 aa  629  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  60.43 
 
 		 573 aa  619  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  54.78 
 
 		 643 aa  615  1e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  56.73 
 
 		 573 aa  615  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  56.96 
 
 		 594 aa  608  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  56.41 
 
 		 588 aa  602  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  59.15 
 
 		 548 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  57.25 
 
 		 584 aa  568  1e-161  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  54.34 
 
 		 600 aa  549  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  55.49 
 
 		 565 aa  541  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  53.72 
 
 		 661 aa  537  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  53.85 
 
 		 619 aa  537  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  57.25 
 
 		 551 aa  537  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0149  ABC transporter related  57.46 
 
 		 528 aa  515  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.171505  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  51.67 
 
 		 597 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  51.12 
 
 		 557 aa  509  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  50.65 
 
 		 561 aa  508  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26140  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  60.1 
 
 		 665 aa  506  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0117472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  49.91 
 
 		 565 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  47.57 
 
 		 606 aa  501  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  50.75 
 
 		 547 aa  501  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  50.37 
 
 		 558 aa  497  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2746  ABC transporter related  51.89 
 
 		 575 aa  497  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  49.28 
 
 		 609 aa  497  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.68 
 
 		 632 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  48.79 
 
 		 546 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.15 
 
 		 548 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  53.06 
 
 		 547 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  49.17 
 
 		 575 aa  488  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  48.47 
 
 		 611 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  48.7 
 
 		 576 aa  489  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  50.55 
 
 		 539 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.81 
 
 		 546 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.5 
 
 		 616 aa  487  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0489  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  56.25 
 
 		 674 aa  485  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.6 
 
 		 633 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  48.89 
 
 		 562 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  52.02 
 
 		 542 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  47.89 
 
 		 633 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  51.28 
 
 		 583 aa  484  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  51.58 
 
 		 563 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  47.23 
 
 		 615 aa  482  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.76 
 
 		 626 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  48.39 
 
 		 609 aa  482  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  49.82 
 
 		 619 aa  482  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3489  glutathione import ATP-binding protein GsiA  49.53 
 
 		 537 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  47.39 
 
 		 640 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  46.69 
 
 		 623 aa  475  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0257  oligopeptide ABC transporter ATPase  54.85 
 
 		 669 aa  476  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.691282  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4051  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.25 
 
 		 633 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.049262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  48.43 
 
 		 568 aa  476  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  46.87 
 
 		 629 aa  476  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.39 
 
 		 611 aa  475  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  47.03 
 
 		 549 aa  478  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0900  glutathione transporter ATP-binding protein  46.69 
 
 		 623 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  48.32 
 
 		 571 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.42 
 
 		 649 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  46.94 
 
 		 610 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  47.82 
 
 		 611 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  46.89 
 
 		 593 aa  478  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41160  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.72 
 
 		 536 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  46.51 
 
 		 612 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  46.51 
 
 		 623 aa  472  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  46.51 
 
 		 612 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  46.33 
 
 		 623 aa  473  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  46.51 
 
 		 623 aa  472  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.96 
 
 		 643 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  46.6 
 
 		 601 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 623 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.99 
 
 		 634 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.16 
 
 		 634 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  46.51 
 
 		 623 aa  474  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  50.56 
 
 		 538 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.16 
 
 		 634 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.21 
 
 		 617 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 623 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  45.97 
 
 		 623 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.94 
 
 		 599 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  47.45 
 
 		 611 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  48.37 
 
 		 613 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  48.21 
 
 		 625 aa  470  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.33 
 
 		 632 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  46.47 
 
 		 640 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  45.8 
 
 		 623 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  45.93 
 
 		 612 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.14 
 
 		 637 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  47.57 
 
 		 537 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  48.31 
 
 		 541 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  47.2 
 
 		 593 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.98 
 
 		 629 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  48.88 
 
 		 537 aa  465  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  46.4 
 
 		 601 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  45.8 
 
 		 623 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  50 
 
 		 531 aa  466  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.89 
 
 		 625 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  45.7 
 
 		 586 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.77 
 
 		 619 aa  466  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1824  ABC transporter related  49.91 
 
 		 542 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  47.06 
 
 		 624 aa  462  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>