More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3499 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3499  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
366 aa  723    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66689  decreased coverage  0.000063824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2973  oxidoreductase domain protein  68.23 
 
 
366 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3396  oxidoreductase domain protein  60.6 
 
 
368 aa  420  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0573  oxidoreductase domain-containing protein  55.25 
 
 
372 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3721  oxidoreductase domain protein  58.01 
 
 
373 aa  388  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387593  normal  0.0213172 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0251  oxidoreductase domain protein  54.14 
 
 
373 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03860  predicted dehydrogenase  54.42 
 
 
383 aa  371  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2540  oxidoreductase domain protein  56.41 
 
 
379 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5340  oxidoreductase domain protein  57.18 
 
 
375 aa  365  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2337  oxidoreductase domain protein  57.89 
 
 
368 aa  354  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27520  predicted dehydrogenase  51.81 
 
 
380 aa  333  2e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  50.27 
 
 
369 aa  330  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  49.73 
 
 
373 aa  326  5e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  44.29 
 
 
368 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0976  oxidoreductase domain protein  44.96 
 
 
379 aa  296  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239021  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0066  oxidoreductase domain protein  47.34 
 
 
379 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3103  oxidoreductase domain-containing protein  45.58 
 
 
367 aa  293  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0783831 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  46.39 
 
 
374 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1683  oxidoreductase domain protein  45.13 
 
 
366 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1864  oxidoreductase domain protein  44.54 
 
 
366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.561722 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2952  oxidoreductase domain-containing protein  44.74 
 
 
366 aa  282  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0084  oxidoreductase domain-containing protein  45.71 
 
 
370 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1601  oxidoreductase domain protein  45.88 
 
 
378 aa  275  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.90648  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  40.72 
 
 
368 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0121  oxidoreductase domain protein  46.52 
 
 
380 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01570  predicted dehydrogenase  45.85 
 
 
357 aa  271  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3988  putative dehydrogenase/oxidoreductase  42.65 
 
 
365 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4443  oxidoreductase domain protein  42.74 
 
 
366 aa  263  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.280845  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0137  oxidoreductase domain protein  39.3 
 
 
377 aa  257  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20460  predicted dehydrogenase  43.15 
 
 
371 aa  255  8e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.95226 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2092  oxidoreductase domain protein  41.42 
 
 
377 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.373811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1722  oxidoreductase domain-containing protein  41.46 
 
 
377 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2331  oxidoreductase domain protein  40.33 
 
 
377 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3459  oxidoreductase domain-containing protein  39.51 
 
 
388 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2407  hypothetical protein  39.57 
 
 
377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677098  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  40.64 
 
 
382 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  36.29 
 
 
368 aa  239  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  38.78 
 
 
379 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  38.69 
 
 
382 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0776  oxidoreductase-like  40.21 
 
 
391 aa  232  9e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1191  oxidoreductase domain protein  41.76 
 
 
383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476401  normal  0.346869 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4326  oxidoreductase domain-containing protein  39.38 
 
 
357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.737288 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2265  oxidoreductase domain protein  36.39 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0012315  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2482  oxidoreductase domain-containing protein  37.02 
 
 
644 aa  185  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.230989  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0459  oxidoreductase domain protein  33.98 
 
 
358 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.617466 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1937  oxidoreductase domain protein  31.39 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000651209  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1881  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 
372 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0040112  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0109  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.38 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0100  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  40.38 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2549  oxidoreductase domain protein  26.85 
 
 
375 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1993  aldo/keto reductase  31.44 
 
 
657 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 
352 aa  116  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4236  oxidoreductase domain-containing protein  37.5 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223276  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 
369 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1571  oxidoreductase domain protein  26.38 
 
 
377 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3182  oxidoreductase domain-containing protein  29.69 
 
 
376 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.791992 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0519  aldo/keto reductase  32.94 
 
 
665 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.798148  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  36.13 
 
 
332 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  29.52 
 
 
363 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  32.16 
 
 
353 aa  93.2  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  25.49 
 
 
347 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  30.33 
 
 
344 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0140  oxidoreductase domain protein  30.64 
 
 
386 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 
387 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  31.67 
 
 
385 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 
355 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  33.02 
 
 
336 aa  87.4  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  29.1 
 
 
359 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1721  putative oxidoreductase  29.71 
 
 
384 aa  86.7  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.777157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  25.74 
 
 
388 aa  83.2  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1077  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
384 aa  82.8  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  31.58 
 
 
350 aa  82.8  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 
384 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.58 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0624  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0754033  normal  0.160836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4044  oxidoreductase domain protein  34.31 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.568923  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1241  oxidoreductase domain protein  26.88 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  36.42 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  36.9 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  27.44 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3331  oxidoreductase domain-containing protein  30.37 
 
 
382 aa  79.3  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.782601 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1105  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  26.61 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  30.85 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  28.01 
 
 
376 aa  77  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 
364 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  30.5 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  31.88 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  36.84 
 
 
380 aa  76.3  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  30.51 
 
 
351 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  30.71 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  26.22 
 
 
378 aa  75.5  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 
377 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>