More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3488 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
474 aa  954    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.1 
 
 
476 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  38.41 
 
 
480 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  37.6 
 
 
532 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.09 
 
 
451 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.5 
 
 
542 aa  230  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  34.77 
 
 
487 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.61 
 
 
466 aa  211  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  30.84 
 
 
444 aa  208  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  30.62 
 
 
444 aa  206  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  31.76 
 
 
448 aa  202  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  32.02 
 
 
501 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  32.83 
 
 
495 aa  182  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.04 
 
 
490 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.82 
 
 
449 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  31.24 
 
 
461 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  29.11 
 
 
474 aa  170  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.4 
 
 
492 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  29.01 
 
 
458 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  25.83 
 
 
448 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  33.26 
 
 
465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  27.23 
 
 
461 aa  167  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.27 
 
 
461 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  32.08 
 
 
451 aa  163  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  30.38 
 
 
479 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  30.38 
 
 
479 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  25.83 
 
 
448 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  30.59 
 
 
461 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.64 
 
 
472 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.17 
 
 
444 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  31.04 
 
 
468 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  30.2 
 
 
476 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.8 
 
 
464 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  30.74 
 
 
473 aa  152  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  30.47 
 
 
479 aa  149  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5613  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.6 
 
 
445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  31.4 
 
 
469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  29.5 
 
 
463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  26.71 
 
 
705 aa  148  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  43.72 
 
 
463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  29.92 
 
 
459 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  30.64 
 
 
456 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.94 
 
 
479 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  29.11 
 
 
470 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  32.54 
 
 
474 aa  144  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  31.26 
 
 
479 aa  144  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.92 
 
 
490 aa  143  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  27 
 
 
461 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  30.04 
 
 
545 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  29.21 
 
 
477 aa  139  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  28.66 
 
 
465 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  37.14 
 
 
478 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  28.26 
 
 
465 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  30.04 
 
 
602 aa  137  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.25 
 
 
734 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  28.95 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0479  hypothetical protein  30.09 
 
 
328 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  30.29 
 
 
460 aa  133  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  34.58 
 
 
473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  35.92 
 
 
462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  29.89 
 
 
466 aa  129  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  35.71 
 
 
499 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  35.92 
 
 
462 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  29.92 
 
 
461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  38.17 
 
 
456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  37.6 
 
 
456 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.23 
 
 
484 aa  126  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  30.2 
 
 
764 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  40.48 
 
 
466 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.32 
 
 
481 aa  124  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  29.98 
 
 
752 aa  123  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  27.52 
 
 
477 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  28.43 
 
 
753 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  27.96 
 
 
465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  35.15 
 
 
563 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  30.42 
 
 
754 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0318  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  28.72 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000970405  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.65 
 
 
864 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.65 
 
 
864 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  33.65 
 
 
864 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.65 
 
 
614 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.4 
 
 
478 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  30.84 
 
 
449 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  31.08 
 
 
459 aa  117  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.69 
 
 
726 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  25.61 
 
 
473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.85 
 
 
469 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  27.64 
 
 
775 aa  114  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.79 
 
 
891 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.12 
 
 
896 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.67 
 
 
465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.42 
 
 
448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  35.39 
 
 
758 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.63 
 
 
896 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.63 
 
 
896 aa  110  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  32.21 
 
 
894 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.3 
 
 
574 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  29.96 
 
 
446 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3156  FAD linked oxidase-like protein  33.66 
 
 
577 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.69 
 
 
462 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>