More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3447 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 296 aa  587  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  62.5 
 
 		 296 aa  340  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  46.76 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  44.18 
 
 		 296 aa  239  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  44.22 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  47.9 
 
 		 298 aa  205  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  44.98 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  43.84 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  41.58 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  38.79 
 
 		 293 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  40.55 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  38.19 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  38.75 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  38.44 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  39.38 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  38.85 
 
 		 277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  37.88 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  41.06 
 
 		 323 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  37.88 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  36.86 
 
 		 293 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  37.5 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.88 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  34.14 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.13 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  36.42 
 
 		 288 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  37.29 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  35.96 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  35.96 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  41.46 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  35.96 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  34.11 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  34.11 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  35.74 
 
 		 294 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  36.95 
 
 		 339 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 294 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  35.41 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  37.82 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  34.14 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  33.33 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  34.83 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  36.18 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  34 
 
 		 305 aa  126  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  34.48 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  34.58 
 
 		 291 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  34.81 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  37.33 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  34.36 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  34.23 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  34.51 
 
 		 229 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  34.69 
 
 		 283 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  34.13 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  31.49 
 
 		 341 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  31.49 
 
 		 341 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  36.16 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  35.27 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  35.27 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  33.89 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  35.27 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  33.76 
 
 		 317 aa  119  7.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.75 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  35.62 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  34.2 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  35.64 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  36.12 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  36.36 
 
 		 294 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 294 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 294 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  37.24 
 
 		 277 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  35.96 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  36.43 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  36.9 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  38.97 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  34.01 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  33 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  33.77 
 
 		 306 aa  113  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  39.7 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  36.08 
 
 		 307 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  39.54 
 
 		 393 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  32.54 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  36.45 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  36.45 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  43.26 
 
 		 155 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  33.33 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  35.89 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  31.58 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  31.19 
 
 		 341 aa  106  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  36.52 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.92 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  31.83 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  36.1 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  36.41 
 
 		 373 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  31.92 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>