More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3433 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  100 
 
 
289 aa  575  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  56.79 
 
 
289 aa  318  6e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  49.31 
 
 
289 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  47.97 
 
 
297 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.59 
 
 
299 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  42.66 
 
 
294 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  38.01 
 
 
289 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 
293 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  37.75 
 
 
293 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  37.41 
 
 
292 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  37.28 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 
293 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  40.6 
 
 
298 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  36.82 
 
 
288 aa  143  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  39.21 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  39.26 
 
 
296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  34.97 
 
 
282 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  33.99 
 
 
295 aa  133  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.01 
 
 
288 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 
295 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  34.87 
 
 
295 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 
295 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  43 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  35.03 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  33.22 
 
 
315 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  35.05 
 
 
294 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  35.05 
 
 
294 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  34.71 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  34.81 
 
 
291 aa  125  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.15 
 
 
284 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  33.11 
 
 
297 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 
290 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  38.54 
 
 
291 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  34.28 
 
 
283 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  34.38 
 
 
295 aa  122  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  33.89 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
277 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  33.67 
 
 
294 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  34.58 
 
 
293 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 
294 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  34.58 
 
 
293 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  32.76 
 
 
297 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  37.37 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  34.36 
 
 
293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  34.24 
 
 
293 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 
297 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
294 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  32.64 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  36.27 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  40.21 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  32.65 
 
 
341 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
341 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  32.54 
 
 
295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  37.5 
 
 
229 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  37.19 
 
 
277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  34 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  37.97 
 
 
373 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  33.9 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.46 
 
 
288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  36.49 
 
 
290 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
292 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  33.56 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  34.56 
 
 
347 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 
298 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  33.68 
 
 
298 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 
290 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 
298 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  35.06 
 
 
308 aa  108  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  32.18 
 
 
293 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  33.9 
 
 
296 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  34.25 
 
 
288 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  36.78 
 
 
393 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  34.8 
 
 
294 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  32.87 
 
 
309 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  34.88 
 
 
285 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  33.22 
 
 
291 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  36.3 
 
 
315 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  34 
 
 
302 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  40.26 
 
 
301 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  33.44 
 
 
300 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
293 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  30.52 
 
 
317 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
275 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  32.14 
 
 
287 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  35.66 
 
 
305 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  33.44 
 
 
321 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  32.67 
 
 
305 aa  97.4  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  33.55 
 
 
314 aa  96.7  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  32.78 
 
 
303 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
296 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  35.03 
 
 
310 aa  96.3  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  32.99 
 
 
294 aa  95.9  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  33.33 
 
 
281 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  33.67 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  34.39 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  34.13 
 
 
339 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>