More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3409 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3409  transcriptional regulator ArgP, LysR family  100 
 
 		 299 aa  599  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305012  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5932  chromosome replication initiation inhibitor protein  54.22 
 
 		 315 aa  291  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2384  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  52.68 
 
 		 298 aa  287  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5075  chromosome replication initiation inhibitor protein  52.84 
 
 		 288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1650  chromosome replication initiation inhibitor protein  51.01 
 
 		 298 aa  256  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.124746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0665  transcriptional regulator, LysR family  50.51 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4012  transcriptional regulator, LysR family  49.66 
 
 		 284 aa  245  8e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.725863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3123  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.94 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.714101  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0158  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  48.58 
 
 		 292 aa  240  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.804974 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2242  transcriptional regulator, LysR family  49.47 
 
 		 292 aa  238  8e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.124201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1085  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.43 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4638  transcriptional regulator, ArgP family  45.39 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.199138  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0354  chromosome replication initiation inhibitor protein  48.03 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0364  chromosome replication initiation inhibitor protein  48.03 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1974  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.27 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0576454  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21240  transcriptional regulator, ArgP family  46.05 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4431  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.59 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615047  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0269  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.83 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.875741 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2434  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.48 
 
 		 295 aa  229  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.609977  hitchhiker  0.000411507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0343  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.31 
 
 		 304 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12016  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.67 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2987  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.32 
 
 		 299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2173  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.44 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.342879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1844  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.36 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0362  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.19 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0453473 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1891  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.47 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1698  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.07 
 
 		 309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2866  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.52 
 
 		 306 aa  219  5e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1175  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.95 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.578075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2344  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.6 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0367629  hitchhiker  0.0000000918792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0375  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.65 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.868101 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0393  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.03 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0982  LysR family transcriptional regulator  45 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2416  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.27 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.343193  hitchhiker  0.00112785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1652  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.27 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.963239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2671  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.64 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000215658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2594  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.96 
 
 		 311 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000186754  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2836  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.81 
 
 		 301 aa  214  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.240548 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1788  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.64 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405332  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2556  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.64 
 
 		 311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000319404  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3863  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.01 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2085  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.36 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3485  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  51.89 
 
 		 299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.493863 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2774  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.86 
 
 		 295 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4371  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.04 
 
 		 305 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4249  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.86 
 
 		 298 aa  211  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373423  normal  0.150215 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2962  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.33 
 
 		 297 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4164  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.14 
 
 		 299 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.221393  normal  0.317315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56740  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.28 
 
 		 300 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3749  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  43.51 
 
 		 303 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2358  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.4 
 
 		 302 aa  208  7e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17613  normal  0.155084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4934  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.64 
 
 		 298 aa  208  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1507  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.2 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2974  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.93 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0195  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  43.23 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3862  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.55 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11860  transcriptional regulator, ArgP family  41.75 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1704  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.32 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3693  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.86 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1904  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.07 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2012  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.59 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1829  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.84 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999172  hitchhiker  0.00188164 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4178  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.75 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.257723  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2509  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.39 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3162  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.39 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1573  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.09 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3474  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.48 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.07 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.39 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4483  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.93 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0658  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.28 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117033  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0050  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.74 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2388  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.78 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00311135  hitchhiker  0.00401295 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5007  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.13 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5362  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.11 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4796  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.67 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.43549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3148  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.13 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.99123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5388  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.67 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5473  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.67 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259043  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4487  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.07 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5123  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.07 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2144  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.69 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.184842 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5736  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.07 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1538  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.71 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3099  transcriptional regulator LysR family  41.91 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4815  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.11 
 
 		 301 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173708  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0030  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.71 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1183  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.71 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1463  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.71 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.71 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0180  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.27 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.240236 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3139  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.07 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.677329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5298  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.43 
 
 		 297 aa  191  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1833  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.47 
 
 		 325 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.565601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0835  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.47 
 
 		 319 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2099  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.47 
 
 		 325 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1126  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.47 
 
 		 325 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0698805  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0429  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.47 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1116  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.93 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2146  chromosome replication initiation inhibitor protein  40 
 
 		 323 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>