169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3392 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 
260 aa  533  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  35.21 
 
 
280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.56 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  39.41 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.14 
 
 
261 aa  116  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  37.57 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  31.05 
 
 
276 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.26 
 
 
276 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.6 
 
 
239 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  30.45 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  26.48 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.38 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  26.54 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  28.9 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2748  hypothetical protein  28.11 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  27.18 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  27.18 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.36 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.23 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  27.18 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  27.18 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  32.18 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.2 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2621  hypothetical protein  27.03 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.22 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  35.51 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.75 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.34 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.34 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.74 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  35.51 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.33 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.46 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.82 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.82 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.81 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.17 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.86 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  27.98 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.36 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.83 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  22.99 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.69 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46163  predicted protein  26.82 
 
 
326 aa  65.5  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911457  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.66 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  28.74 
 
 
281 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
270 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  25.4 
 
 
289 aa  64.7  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  28.63 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  27.34 
 
 
306 aa  63.5  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  23.53 
 
 
266 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.12 
 
 
257 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.18 
 
 
257 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.93 
 
 
253 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.8 
 
 
293 aa  62.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2489  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.77 
 
 
309 aa  62.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.3 
 
 
296 aa  62.4  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.09 
 
 
302 aa  62.4  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.14 
 
 
257 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.9 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.3 
 
 
281 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  26.24 
 
 
268 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  26.29 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.67 
 
 
394 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.99 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2672  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.08 
 
 
309 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  23.85 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.92 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.22 
 
 
302 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.09 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.91 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3257  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.4 
 
 
305 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867901  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.93 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  26.87 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.59 
 
 
257 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.67 
 
 
394 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.39 
 
 
268 aa  59.7  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  32.26 
 
 
256 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  32.26 
 
 
253 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  32.26 
 
 
297 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  32.26 
 
 
253 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.26 
 
 
306 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  32.26 
 
 
306 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  24.58 
 
 
299 aa  58.9  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  23.68 
 
 
296 aa  58.9  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.37 
 
 
265 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  22.42 
 
 
278 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  24.14 
 
 
308 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  24.14 
 
 
308 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.32 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  29.49 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0578  hypothetical protein  30 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0554  hypothetical protein  30 
 
 
310 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.17 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  31.45 
 
 
306 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  24.37 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2124  non-haem iron halogenase  24.02 
 
 
319 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  25.86 
 
 
307 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.68 
 
 
315 aa  56.6  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>