More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3344 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
306 aa  627  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  56.6 
 
 
331 aa  358  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  53.59 
 
 
334 aa  327  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  51.13 
 
 
340 aa  305  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  49.36 
 
 
346 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  45.86 
 
 
325 aa  285  9e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  48.06 
 
 
328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  44.13 
 
 
326 aa  278  7e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  47.87 
 
 
330 aa  275  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  46.33 
 
 
321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  45.66 
 
 
327 aa  272  6e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  44.05 
 
 
326 aa  271  9e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  43.73 
 
 
326 aa  268  7e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  43.73 
 
 
326 aa  268  7e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  44.81 
 
 
333 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  44.59 
 
 
350 aa  262  4.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  47.54 
 
 
362 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  43.59 
 
 
332 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  43.91 
 
 
329 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  44.34 
 
 
327 aa  258  7e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  44.62 
 
 
334 aa  258  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  47.37 
 
 
322 aa  258  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  42.63 
 
 
322 aa  257  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  45.07 
 
 
339 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  42.36 
 
 
320 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  43.87 
 
 
333 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  44.19 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  45.02 
 
 
332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  44.73 
 
 
333 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  47.08 
 
 
314 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  42.63 
 
 
347 aa  253  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  47.93 
 
 
333 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 
321 aa  251  9.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  41.94 
 
 
326 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  45.18 
 
 
324 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  45.21 
 
 
342 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  44.73 
 
 
322 aa  250  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  46.71 
 
 
320 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  43 
 
 
329 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  41.59 
 
 
326 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  45.64 
 
 
318 aa  248  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  44.37 
 
 
344 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.7 
 
 
330 aa  246  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  44.55 
 
 
323 aa  246  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  46.1 
 
 
315 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  44.41 
 
 
328 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  44.73 
 
 
317 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  43.87 
 
 
348 aa  245  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
316 aa  245  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  44.92 
 
 
356 aa  244  9e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  42.86 
 
 
331 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  45.86 
 
 
315 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  46.15 
 
 
315 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  46.15 
 
 
315 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  41.88 
 
 
352 aa  242  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  45.86 
 
 
315 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  41.16 
 
 
332 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  46.53 
 
 
332 aa  239  5.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  43.17 
 
 
320 aa  238  6.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 
335 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  44.09 
 
 
317 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  43.18 
 
 
313 aa  238  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 
335 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  43.08 
 
 
319 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  42.38 
 
 
317 aa  237  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  39.75 
 
 
335 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  42.37 
 
 
335 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  46.53 
 
 
330 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  46.51 
 
 
338 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2471  transcriptional regulator, AraC family  44.86 
 
 
327 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117682  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  45.26 
 
 
342 aa  235  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  44.06 
 
 
314 aa  235  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
349 aa  234  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  46.55 
 
 
333 aa  234  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  44.19 
 
 
338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6224  AraC family transcriptional regulator  49.15 
 
 
367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  47.2 
 
 
341 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  47.2 
 
 
341 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  40.38 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  40.91 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  39.03 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 
335 aa  232  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  40.13 
 
 
321 aa  228  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  41.88 
 
 
324 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  41.1 
 
 
324 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  41.56 
 
 
324 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 
325 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  37.86 
 
 
317 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  41.37 
 
 
324 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  40.78 
 
 
320 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  40.78 
 
 
320 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  41.69 
 
 
337 aa  225  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  38.71 
 
 
318 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  37.82 
 
 
317 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  38.71 
 
 
318 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  38.71 
 
 
318 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  38.71 
 
 
318 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  38.71 
 
 
318 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  40.42 
 
 
346 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>