150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3257 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  100 
 
 
499 aa  1011    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  38.41 
 
 
493 aa  281  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  34.79 
 
 
476 aa  243  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  30.38 
 
 
504 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  30.2 
 
 
505 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  32.31 
 
 
525 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  30.26 
 
 
499 aa  196  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  30.54 
 
 
546 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  28.66 
 
 
504 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  30.6 
 
 
750 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  30.89 
 
 
506 aa  180  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  31.59 
 
 
515 aa  175  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  29.93 
 
 
486 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  30.33 
 
 
518 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  29.05 
 
 
521 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  28.87 
 
 
478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  28.78 
 
 
507 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2750  TAP domain-containing protein  29.26 
 
 
490 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51195  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  29.4 
 
 
541 aa  163  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  30.38 
 
 
459 aa  163  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  26.84 
 
 
521 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  28.1 
 
 
508 aa  161  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  30.63 
 
 
505 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  29.46 
 
 
511 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  29.46 
 
 
511 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  29.46 
 
 
511 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  30.07 
 
 
564 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  33.65 
 
 
515 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  28.36 
 
 
537 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  28.33 
 
 
532 aa  157  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  29.04 
 
 
525 aa  156  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  29.79 
 
 
535 aa  156  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  28.84 
 
 
522 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  30.11 
 
 
527 aa  154  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  28.73 
 
 
555 aa  153  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  28.31 
 
 
520 aa  153  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  27.88 
 
 
495 aa  153  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  29.17 
 
 
495 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  27.1 
 
 
524 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  28.92 
 
 
530 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  30.27 
 
 
546 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  29.1 
 
 
500 aa  150  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  29.92 
 
 
504 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  29.12 
 
 
515 aa  150  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  30.02 
 
 
539 aa  148  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  28.85 
 
 
542 aa  148  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  29.3 
 
 
475 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  29.8 
 
 
485 aa  146  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  28.75 
 
 
551 aa  146  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  29.19 
 
 
523 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  31.65 
 
 
532 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  28.93 
 
 
542 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  28.02 
 
 
508 aa  143  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  27.09 
 
 
520 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  25.92 
 
 
518 aa  142  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  28.9 
 
 
506 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  26.75 
 
 
545 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  29.21 
 
 
484 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  28.39 
 
 
535 aa  136  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  29.58 
 
 
521 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  25.66 
 
 
516 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  29.09 
 
 
518 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  28.18 
 
 
533 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  28.18 
 
 
508 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  28.18 
 
 
508 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  28.36 
 
 
522 aa  133  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  28.29 
 
 
547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  28.73 
 
 
538 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  28.27 
 
 
536 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  27.22 
 
 
542 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  28.17 
 
 
521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 
486 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  27.74 
 
 
571 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  26.23 
 
 
544 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  28.82 
 
 
540 aa  123  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  27.29 
 
 
505 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  29.65 
 
 
527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  23.54 
 
 
505 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  28.03 
 
 
556 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  34.54 
 
 
300 aa  119  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  29.19 
 
 
557 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  26.22 
 
 
520 aa  115  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
505 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  27.2 
 
 
522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  34.58 
 
 
551 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  29.71 
 
 
643 aa  110  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  30.28 
 
 
514 aa  110  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  24.51 
 
 
597 aa  110  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  26.06 
 
 
517 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  29.37 
 
 
542 aa  104  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02580  alpha/beta hydrolase family protein  26.34 
 
 
623 aa  101  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.978734  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  23.99 
 
 
480 aa  100  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  26.79 
 
 
524 aa  99.4  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  32.51 
 
 
613 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  23.62 
 
 
494 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  28.34 
 
 
525 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2785  TAP domain protein  26.85 
 
 
480 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  26.4 
 
 
533 aa  95.1  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  32.8 
 
 
597 aa  89.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  27.71 
 
 
559 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>