More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3226 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  56.1 
 
 		 733 aa  681    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  50.84 
 
 		 788 aa  649    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.15 
 
 		 734 aa  687    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.33 
 
 		 691 aa  761    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  100 
 
 		 691 aa  1369    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.24 
 
 		 749 aa  727    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.11 
 
 		 712 aa  747    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  54.4 
 
 		 745 aa  679    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  60.29 
 
 		 724 aa  746    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.59 
 
 		 754 aa  745    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  60.58 
 
 		 718 aa  751    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  62.8 
 
 		 706 aa  797    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.56 
 
 		 712 aa  721    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.4 
 
 		 704 aa  766    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  62.08 
 
 		 689 aa  798    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.28 
 
 		 708 aa  709    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  53.97 
 
 		 766 aa  663    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.89 
 
 		 762 aa  638    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  62.21 
 
 		 691 aa  760    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.74 
 
 		 691 aa  761    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.76 
 
 		 979 aa  706    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  56.71 
 
 		 756 aa  665    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  58.62 
 
 		 723 aa  766    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.15 
 
 		 729 aa  694    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.89 
 
 		 713 aa  696    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.5 
 
 		 714 aa  710    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.74 
 
 		 691 aa  761    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  53.02 
 
 		 741 aa  614  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.42 
 
 		 706 aa  561  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.57 
 
 		 756 aa  544  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.91 
 
 		 706 aa  543  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.77 
 
 		 708 aa  541  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.57 
 
 		 697 aa  522  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  48.64 
 
 		 698 aa  520  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.67 
 
 		 679 aa  512  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.36 
 
 		 693 aa  509  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.86 
 
 		 695 aa  504  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.91 
 
 		 698 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.42 
 
 		 691 aa  481  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.37 
 
 		 698 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.71 
 
 		 693 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.28 
 
 		 698 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.61 
 
 		 699 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.34 
 
 		 697 aa  468  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.25 
 
 		 691 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.07 
 
 		 602 aa  243  6e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.08 
 
 		 448 aa  235  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.87 
 
 		 543 aa  227  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.87 
 
 		 543 aa  227  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.87 
 
 		 543 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.27 
 
 		 588 aa  220  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.89 
 
 		 1376 aa  219  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.48 
 
 		 552 aa  217  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.39 
 
 		 590 aa  216  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.97 
 
 		 646 aa  207  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.45 
 
 		 626 aa  205  3e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.68 
 
 		 708 aa  205  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.61 
 
 		 535 aa  203  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  36.92 
 
 		 679 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 		 562 aa  203  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.67 
 
 		 590 aa  201  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 		 592 aa  201  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.81 
 
 		 556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.76 
 
 		 716 aa  199  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.13 
 
 		 624 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.04 
 
 		 545 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.46 
 
 		 606 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.59 
 
 		 630 aa  197  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.95 
 
 		 568 aa  196  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1249  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.01 
 
 		 557 aa  195  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.42 
 
 		 592 aa  194  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.22 
 
 		 563 aa  193  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1924  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family protein  35.51 
 
 		 669 aa  193  8e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.52 
 
 		 607 aa  193  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.58 
 
 		 724 aa  192  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1335  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 		 592 aa  192  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.764051  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4237  RecQ domain-containing protein  33.6 
 
 		 690 aa  192  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.69 
 
 		 615 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.58 
 
 		 721 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.43 
 
 		 593 aa  191  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.43 
 
 		 593 aa  191  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.42 
 
 		 607 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.88 
 
 		 546 aa  190  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.42 
 
 		 607 aa  190  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  36.69 
 
 		 493 aa  190  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1318  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.73 
 
 		 419 aa  189  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.227704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.83 
 
 		 592 aa  189  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.42 
 
 		 607 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.42 
 
 		 607 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3396  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  34.13 
 
 		 636 aa  188  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.84 
 
 		 599 aa  188  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.09 
 
 		 634 aa  188  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.85 
 
 		 714 aa  188  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.43 
 
 		 725 aa  187  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.67 
 
 		 622 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2292  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.83 
 
 		 645 aa  187  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00114874  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.55 
 
 		 601 aa  187  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.34 
 
 		 600 aa  187  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.23 
 
 		 599 aa  187  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1782  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.39 
 
 		 646 aa  187  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>