54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3195 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3195  hemopexin repeat-containing protein  100 
 
 
262 aa  531  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000696311  hitchhiker  0.000000000670294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  52.99 
 
 
280 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  44.66 
 
 
279 aa  194  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3187  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  44.32 
 
 
289 aa  194  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280318  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29530  uncharacterized AP superfamily protein  44.91 
 
 
287 aa  182  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  37.4 
 
 
531 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1868  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.23 
 
 
304 aa  146  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148816  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.26 
 
 
489 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  36.78 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.58 
 
 
519 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0968  hypothetical protein  30.52 
 
 
413 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1007  hypothetical protein  29.1 
 
 
394 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.32 
 
 
321 aa  94.7  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.49777  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0975  hypothetical protein  28.93 
 
 
416 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3392  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.26 
 
 
414 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6789  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.98 
 
 
415 aa  89.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0417562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6200  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.1 
 
 
413 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1785  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.89 
 
 
574 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.41 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3458  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.37 
 
 
687 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149528  normal  0.571411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3216  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.72 
 
 
629 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  27.07 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.51 
 
 
478 aa  63.5  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.21 
 
 
499 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.56 
 
 
499 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0374  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.19 
 
 
437 aa  55.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0394  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.6 
 
 
437 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0371  type I phosphodiesterase  24.6 
 
 
437 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00015541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.6 
 
 
437 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0361814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0368  type I phosphodiesterase  24.6 
 
 
437 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000500368  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0438  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.6 
 
 
437 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1028  hypothetical protein  23.2 
 
 
268 aa  52.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2638  hypothetical protein  24.71 
 
 
676 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.828392  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1878  phosphodiesterase I  26.41 
 
 
428 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.872565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.78 
 
 
312 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1605  hypothetical protein  23.6 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0824779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3879  hypothetical protein  23.53 
 
 
287 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3820  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.12 
 
 
398 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.26 
 
 
558 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2169  phosphodiesterase I  23.18 
 
 
433 aa  46.2  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2080  phosphodiesterase I  23.18 
 
 
433 aa  45.8  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1824  hypothetical protein  25.21 
 
 
278 aa  46.2  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.044813  normal  0.779057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  24.5 
 
 
268 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000662  hypothetical protein  25 
 
 
274 aa  45.8  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281992  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20320  uncharacterized AP superfamily protein  25.55 
 
 
427 aa  45.4  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.291938  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  23.85 
 
 
422 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1331  hypothetical protein  24.49 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250532  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4286  hypothetical protein  23.68 
 
 
678 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.119503  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1274  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.24 
 
 
268 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.303048 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2123  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22 
 
 
388 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3994  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.24 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236352  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02580  phosphoethanolamine N-methyltransferase, putative  31.76 
 
 
1037 aa  42.7  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1725  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.24 
 
 
278 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0109136 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  23.01 
 
 
261 aa  42  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>