50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3172 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3172  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
257 aa  521  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0232436  hitchhiker  0.0000000099783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3956  aminoglycoside phosphotransferase  46.72 
 
 
251 aa  211  7.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4777  aminoglycoside phosphotransferase  40.82 
 
 
281 aa  161  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2126  aminoglycoside phosphotransferase  36.89 
 
 
247 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.171035  normal  0.0430024 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1031  trifolitoxin immunity protein  33.47 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3328  aminoglycoside phosphotransferase  32.81 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1028  trifolitoxin immunity protein  33.06 
 
 
263 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102871  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0079  aminoglycoside phosphotransferase  37.05 
 
 
259 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4156  trifolitoxin immunity protein  32.65 
 
 
263 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000289256  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1183  trifolitoxin immunity protein  33.61 
 
 
263 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00210871  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1186  aminoglycoside phosphotransferase  38.43 
 
 
286 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1288  trifolitoxin immunity domain protein  32.79 
 
 
263 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000214818  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1053  trifolitoxin immunity domain-containing protein  32.65 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000137711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1133  trifolitoxin immunity domain-containing protein  32.65 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000583619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1230  trifolitoxin immunity domain-containing protein  32.38 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000170799  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0761  aminoglycoside phosphotransferase  36.25 
 
 
273 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230447  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1296  aminoglycoside phosphotransferase  40.59 
 
 
295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240005  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7402  hypothetical protein  43.59 
 
 
266 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1734  aminoglycoside phosphotransferase  39.57 
 
 
283 aa  135  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04894  hypothetical protein  33.88 
 
 
261 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6530  aminoglycoside phosphotransferase  37.4 
 
 
238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0352215  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2326  aminoglycoside phosphotransferase  34.85 
 
 
256 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030159 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1471  putative antibiotic resistance protein  34.73 
 
 
262 aa  125  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.292447  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000753  hypothetical protein  33.2 
 
 
257 aa  125  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2954  aminoglycoside phosphotransferase  44.31 
 
 
255 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00316699  decreased coverage  0.00012693 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2798  aminoglycoside phosphotransferase  37.65 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5213  putative aminoglycoside phosphotransferase protein (antibiotic resistance protein)  38.14 
 
 
279 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5377  aminoglycoside phosphotransferase  33.47 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.556886  normal  0.652804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35590  phosphotransferase family protein  32.28 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.886492  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4227  aminoglycoside phosphotransferase  39.62 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.722733 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1068  aminoglycoside phosphotransferase  37.73 
 
 
252 aa  113  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2262  aminoglycoside phosphotransferase  31.4 
 
 
253 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.657806 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1013  aminoglycoside phosphotransferase  40.11 
 
 
279 aa  102  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1395  putative trifolitoxin immunity protein  32.24 
 
 
243 aa  99  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.815075  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1421  putative trifolitoxin immunity protein  32.5 
 
 
254 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1984  putative TfxG-like immunity protein against TfxA-like peptides  37.97 
 
 
291 aa  94  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1212  trifolitoxin immunity protein  37.19 
 
 
140 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3867  aminoglycoside phosphotransferase  35.85 
 
 
264 aa  86.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499671  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14970  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  31.12 
 
 
256 aa  85.5  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.448489  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2772  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2040  aminoglycoside phosphotransferase  35.08 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0822  hypothetical protein  38.46 
 
 
219 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740155  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2966  aminoglycoside phosphotransferase  32.92 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5537  aminoglycoside phosphotransferase  30.29 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72204  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5845  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 
345 aa  48.5  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1111  aminoglycoside phosphotransferase  32.88 
 
 
321 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3335  aminoglycoside phosphotransferase  44.19 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2391  hypothetical protein  45.95 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119491  predicted protein  27.27 
 
 
345 aa  43.5  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0654217  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0158  hypothetical protein  26.76 
 
 
234 aa  42  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>