More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3121 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 445 aa  910    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  45.98 
 
 		 455 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  42.89 
 
 		 447 aa  306  5.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  30.93 
 
 		 456 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.18 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  27.53 
 
 		 410 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  27.53 
 
 		 410 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 454 aa  103  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.5 
 
 		 406 aa  103  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  31.01 
 
 		 442 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 411 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  27.37 
 
 		 427 aa  97.4  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.64 
 
 		 439 aa  97.1  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 420 aa  97.1  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 447 aa  96.7  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.96 
 
 		 403 aa  96.7  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 		 414 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.03 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  28.38 
 
 		 422 aa  96.3  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  30.61 
 
 		 429 aa  96.3  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 457 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  32.79 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1955  extracellular solute-binding protein family 1  35 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.974693  hitchhiker  0.000475348 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 419 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 		 414 aa  93.6  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 412 aa  93.2  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  27.11 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  27.11 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  30.36 
 
 		 425 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 421 aa  90.5  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 432 aa  90.5  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 412 aa  90.1  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 422 aa  90.1  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 415 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 424 aa  89  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.42 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 458 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 414 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 450 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  29.72 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 421 aa  87.4  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 419 aa  86.7  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 420 aa  86.3  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 504 aa  86.7  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  32.14 
 
 		 423 aa  86.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 464 aa  85.9  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.36 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 		 454 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  30.54 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  26.64 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  27.46 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 454 aa  83.6  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 450 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 		 460 aa  83.2  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.62 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.88 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  22.63 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0476  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.37 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  26.83 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 453 aa  79.7  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 		 429 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 399 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3000  extracellular solute-binding protein family 1  22.1 
 
 		 450 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2730  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 399 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3956  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.03 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  0.0187852 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  26.91 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.82 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>