More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3006 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
404 aa  821    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  46.48 
 
 
399 aa  360  4e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  47.09 
 
 
402 aa  351  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  48.23 
 
 
407 aa  346  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  48.21 
 
 
393 aa  298  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  46.33 
 
 
400 aa  296  6e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  47.81 
 
 
374 aa  277  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  38.46 
 
 
402 aa  266  5e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  42 
 
 
424 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  42.74 
 
 
400 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  42.94 
 
 
371 aa  263  6e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  41.33 
 
 
424 aa  258  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  39.02 
 
 
372 aa  251  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  41.89 
 
 
396 aa  249  9e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  41.6 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  41.6 
 
 
400 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  41.6 
 
 
400 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  39.63 
 
 
398 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  41.55 
 
 
403 aa  230  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  41.74 
 
 
387 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  38.73 
 
 
397 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  38.5 
 
 
402 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  36.19 
 
 
393 aa  215  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  37.88 
 
 
398 aa  211  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  37.07 
 
 
388 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  37.87 
 
 
400 aa  206  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  36.63 
 
 
370 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  37.6 
 
 
408 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  36.08 
 
 
377 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  36.63 
 
 
403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  34.92 
 
 
467 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  32.98 
 
 
415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  38.34 
 
 
411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  35.88 
 
 
380 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  32.05 
 
 
372 aa  193  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  36.42 
 
 
391 aa  192  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  32.16 
 
 
390 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  35.2 
 
 
389 aa  189  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  34.65 
 
 
396 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  31.61 
 
 
394 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  36.36 
 
 
388 aa  182  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  36.49 
 
 
371 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  29.78 
 
 
384 aa  176  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  32.73 
 
 
388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  32.63 
 
 
496 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  33.9 
 
 
415 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  33.05 
 
 
423 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  32.21 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  32.35 
 
 
351 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  31.23 
 
 
418 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  33.52 
 
 
381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  31.54 
 
 
395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  32.32 
 
 
413 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  31.3 
 
 
405 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  31.71 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  33.96 
 
 
393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  32.64 
 
 
434 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  32.5 
 
 
396 aa  133  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  31.34 
 
 
392 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.34 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  29.89 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  26.03 
 
 
368 aa  107  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  25.77 
 
 
368 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  29.27 
 
 
408 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  32.95 
 
 
399 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  28.66 
 
 
377 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  30.69 
 
 
374 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  29.91 
 
 
377 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  29.57 
 
 
379 aa  93.6  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 
385 aa  92  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  27.01 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  28.87 
 
 
385 aa  90.5  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  28.3 
 
 
408 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  27.33 
 
 
388 aa  86.3  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  29.41 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  27.93 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  25.22 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  27.9 
 
 
411 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  27.92 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  28.05 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  26.97 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  28.49 
 
 
376 aa  84  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  26.12 
 
 
376 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  29.61 
 
 
369 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  28.21 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  28.19 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  28.35 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  25.95 
 
 
369 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  26.27 
 
 
376 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  25.95 
 
 
369 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  28.53 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  27.33 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  27.14 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  25.75 
 
 
374 aa  77  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  28.74 
 
 
382 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  25.5 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  28.94 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  27.2 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  29.52 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  27.67 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>