133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3003 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  100 
 
 
150 aa  291  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  50.36 
 
 
143 aa  122  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  44.44 
 
 
141 aa  113  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4520  DoxX family protein  47.89 
 
 
146 aa  104  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  42.67 
 
 
239 aa  100  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  37.98 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7264  membrane protein-like protein  44.06 
 
 
216 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000149476  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  39.84 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0606  DoxX family protein  45.61 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  43.44 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  36.76 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  37.5 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  39.72 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  40.16 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  39.37 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  44.09 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  39.29 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  35.11 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  39.42 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  36 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  39.04 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  36.43 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  46.77 
 
 
147 aa  60.1  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  34.11 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  36.22 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  36.03 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  37.01 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1441  DoxX family protein  37.5 
 
 
140 aa  57.8  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0421253  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  36.22 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  34.42 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  34.15 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  34.71 
 
 
144 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  32.87 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  37.01 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  34.4 
 
 
171 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  35.16 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  34.74 
 
 
198 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7103  membrane protein-like protein  33.59 
 
 
274 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0284087  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  36.7 
 
 
177 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  32.56 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  36.84 
 
 
148 aa  53.9  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  34.59 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  33.83 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3679  DoxX  33.59 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244445  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  34.43 
 
 
174 aa  52  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  42.64 
 
 
167 aa  52  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  30.34 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0529  DoxX  37.93 
 
 
164 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  32.26 
 
 
175 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  34.65 
 
 
137 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2565  DoxX family protein  36.8 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66193  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1057  DoxX family protein  32.85 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  38.14 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3737  DoxX family protein  37.63 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  36.29 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  31.3 
 
 
279 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3706  DoxX family protein  45.9 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  36.29 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3319  hypothetical protein  36 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  34.81 
 
 
146 aa  47.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  38.14 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4065  DoxX  33.88 
 
 
181 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4140  DoxX family protein  33.88 
 
 
181 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977135  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  36.29 
 
 
147 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  33.66 
 
 
204 aa  47.4  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  32.56 
 
 
130 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2048  DoxX family protein  30.86 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000018933  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  35.2 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2014  DoxX family protein  29.59 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4294  DoxX family protein  33.88 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322086  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  35.48 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  36.22 
 
 
147 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6025  DoxX family protein  35.34 
 
 
283 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  41.98 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  41.98 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  41.98 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  30.88 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  34.4 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  34.4 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4574  DoxX family protein  30.88 
 
 
198 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  33.33 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  28.17 
 
 
172 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  44.26 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  44.26 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  28.68 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  32.59 
 
 
177 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  32.59 
 
 
177 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  29.77 
 
 
136 aa  43.5  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  35.23 
 
 
152 aa  43.5  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  37.4 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08840  predicted membrane protein  33.09 
 
 
211 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.258983  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  35.2 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21600  hypothetical protein  34.07 
 
 
196 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  36.51 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  24.29 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  28.57 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  32.41 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  42.25 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  29.29 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2663  DoxX family protein  40.35 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0368307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>