More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2965 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  100 
 
 
1029 aa  2089    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  45.4 
 
 
999 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  45.4 
 
 
999 aa  492  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  45.4 
 
 
999 aa  492  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  35.12 
 
 
1657 aa  324  7e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  46.24 
 
 
342 aa  288  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  35.56 
 
 
841 aa  281  5e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  44.31 
 
 
585 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  31.88 
 
 
712 aa  246  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  31.6 
 
 
1132 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.43 
 
 
1200 aa  234  6e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  30.12 
 
 
972 aa  226  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.38 
 
 
945 aa  194  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.31 
 
 
892 aa  185  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.86 
 
 
1505 aa  184  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.42 
 
 
953 aa  181  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  28.36 
 
 
1081 aa  181  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  29.59 
 
 
918 aa  176  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  28.91 
 
 
1138 aa  170  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  28.7 
 
 
941 aa  157  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  28.51 
 
 
1444 aa  156  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  27.92 
 
 
1135 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  26.72 
 
 
1182 aa  155  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  27.91 
 
 
1142 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  28.22 
 
 
1143 aa  154  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  27.32 
 
 
1151 aa  148  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.95 
 
 
450 aa  146  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  28.87 
 
 
908 aa  142  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.99 
 
 
442 aa  142  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.16 
 
 
455 aa  139  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  28.91 
 
 
530 aa  138  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  30.57 
 
 
377 aa  137  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  26.03 
 
 
918 aa  135  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.01 
 
 
392 aa  135  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  32.63 
 
 
375 aa  134  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  38.25 
 
 
1332 aa  134  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.77 
 
 
451 aa  134  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.77 
 
 
427 aa  132  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  25.53 
 
 
984 aa  131  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1030  glucose sorbosone dehydrogenase  31.67 
 
 
410 aa  131  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.881804  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.03 
 
 
809 aa  131  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  33.76 
 
 
461 aa  131  8.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  31.99 
 
 
367 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  27.96 
 
 
909 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.63 
 
 
729 aa  130  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  30.45 
 
 
371 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  30.69 
 
 
378 aa  129  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  30.79 
 
 
363 aa  129  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  31.66 
 
 
392 aa  128  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  29.38 
 
 
375 aa  128  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.14 
 
 
414 aa  127  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  30.08 
 
 
370 aa  127  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.55 
 
 
367 aa  126  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.64 
 
 
396 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  29.23 
 
 
374 aa  125  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  29.23 
 
 
374 aa  125  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  31.55 
 
 
366 aa  125  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  31.13 
 
 
430 aa  124  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  29.58 
 
 
410 aa  124  9e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0163  glucose sorbosone dehydrogenase  29.31 
 
 
391 aa  124  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2666  glucose sorbosone dehydrogenase  28.79 
 
 
395 aa  123  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0349598  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  38.82 
 
 
400 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1788  glucose sorbosone dehydrogenase  28.86 
 
 
391 aa  122  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0330731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  28.68 
 
 
387 aa  121  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  29.87 
 
 
377 aa  120  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  32.68 
 
 
422 aa  120  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  35.5 
 
 
374 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2829  glucose sorbosone dehydrogenase  26.85 
 
 
397 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  30.16 
 
 
387 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  29 
 
 
408 aa  120  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  29.61 
 
 
462 aa  120  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  30.28 
 
 
399 aa  120  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.36 
 
 
403 aa  120  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  29.62 
 
 
369 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  29.19 
 
 
388 aa  118  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  26.28 
 
 
395 aa  118  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  31.07 
 
 
471 aa  118  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  28.65 
 
 
418 aa  118  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2167  glucose sorbosone dehydrogenase  29.3 
 
 
360 aa  117  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  36.51 
 
 
518 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
360 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  30.09 
 
 
376 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  28.95 
 
 
382 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  37.25 
 
 
504 aa  116  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  34.76 
 
 
399 aa  115  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  32.56 
 
 
343 aa  115  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3392  glucose sorbosone dehydrogenase  27.75 
 
 
476 aa  115  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428431  normal  0.278741 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  30.7 
 
 
369 aa  115  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.03 
 
 
460 aa  115  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  26.28 
 
 
395 aa  115  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2369  hypothetical protein  29.63 
 
 
384 aa  115  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.265208  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  30.45 
 
 
381 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  29.21 
 
 
388 aa  114  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  29.71 
 
 
381 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  29.39 
 
 
385 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  27.18 
 
 
374 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4595  glucose sorbosone dehydrogenase  30.03 
 
 
390 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  29.39 
 
 
385 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  28.05 
 
 
368 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  35.71 
 
 
482 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>