126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2945 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2945  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  100 
 
 		 505 aa  991    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.000000598538  decreased coverage  0.00000434939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3467  DNA-repair protein  48 
 
 		 528 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3240  hypothetical protein  49.14 
 
 		 524 aa  388  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488053  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3156  UMUC domain protein DNA-repair protein  46.51 
 
 		 510 aa  347  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000974062  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13428  hypothetical protein  44.3 
 
 		 527 aa  334  3e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1175  hypothetical protein  43.21 
 
 		 532 aa  326  6e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1192  hypothetical protein  43.21 
 
 		 529 aa  326  6e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1202  hypothetical protein  43.21 
 
 		 529 aa  326  6e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.344019  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1523  hypothetical protein  42.26 
 
 		 522 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4898  hypothetical protein  42.67 
 
 		 531 aa  312  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.834206  normal  0.0834013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0923  hypothetical protein  39.92 
 
 		 527 aa  310  4e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2288  DNA-repair protein  40.99 
 
 		 562 aa  295  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15750  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.05 
 
 		 589 aa  286  9e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0334276  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2039  hypothetical protein  38.16 
 
 		 581 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.566112  normal  0.522751 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1747  hypothetical protein  39.51 
 
 		 536 aa  283  5.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0994  hypothetical protein  37.76 
 
 		 527 aa  276  6e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5241  hypothetical protein  40.71 
 
 		 535 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0112063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1896  putative DNA-directed DNA polymerase  38.55 
 
 		 520 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.582074  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21280  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.33 
 
 		 553 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00165363  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1440  hypothetical protein  42.7 
 
 		 549 aa  231  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1186  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  29.27 
 
 		 549 aa  160  6e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000707508  normal  0.0119021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5725  hypothetical protein  30.06 
 
 		 468 aa  67  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  27.59 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  28.79 
 
 		 529 aa  63.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.69 
 
 		 499 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2256  hypothetical protein  28.75 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  27.27 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  26.11 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5158  putative nucleotidyltransferase protein  24.89 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1612  putative DNA-directed DNA polymerase  28.3 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  22.17 
 
 		 499 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  28.22 
 
 		 425 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  27.11 
 
 		 433 aa  56.6  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  29.83 
 
 		 419 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  26.11 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  28.25 
 
 		 390 aa  55.1  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.4 
 
 		 503 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  24.46 
 
 		 430 aa  54.7  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  26.19 
 
 		 477 aa  54.3  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2801  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  26 
 
 		 452 aa  53.9  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  27.68 
 
 		 390 aa  53.5  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2667  hypothetical protein  28.63 
 
 		 462 aa  53.5  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4251  hypothetical protein  31.77 
 
 		 395 aa  53.5  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240238  normal  0.380401 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  29.44 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00039  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  25.65 
 
 		 484 aa  52.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000511104  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5604  hypothetical protein  31.25 
 
 		 503 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  27.57 
 
 		 589 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3489  DNA-directed DNA polymerase  32.97 
 
 		 394 aa  51.2  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  27.49 
 
 		 507 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  25.85 
 
 		 413 aa  50.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13073  DNA polymerase IV  32.96 
 
 		 346 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.498558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  23.75 
 
 		 500 aa  50.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  23.31 
 
 		 423 aa  50.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  28.09 
 
 		 480 aa  50.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3205  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  27.67 
 
 		 527 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.663167  normal  0.015197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  27.16 
 
 		 593 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1732  hypothetical protein  25.93 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0965901  hitchhiker  0.00613419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2037  DNA polymerase IV  32.62 
 
 		 354 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279292 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2201  hypothetical protein  28.9 
 
 		 555 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  23.3 
 
 		 467 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  28.64 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  26.32 
 
 		 414 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2295  hypothetical protein  28.29 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  24.33 
 
 		 467 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  24.08 
 
 		 393 aa  48.5  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  26.5 
 
 		 385 aa  48.5  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  25.34 
 
 		 408 aa  48.5  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  28.64 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  25.26 
 
 		 407 aa  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4046  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  24.66 
 
 		 495 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  25.64 
 
 		 361 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3568  DNA-directed DNA polymerase  21.89 
 
 		 393 aa  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  27.05 
 
 		 408 aa  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  25.64 
 
 		 383 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3768  DNA-directed DNA polymerase  22.39 
 
 		 394 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  26.14 
 
 		 417 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  28.28 
 
 		 474 aa  47.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  25.64 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  26.56 
 
 		 391 aa  47.4  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  30.65 
 
 		 399 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00753  DNA polymerase IV  26.15 
 
 		 349 aa  47.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  26.48 
 
 		 522 aa  47  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2005  hypothetical protein  27.4 
 
 		 478 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  24.36 
 
 		 357 aa  47  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  25.21 
 
 		 379 aa  47  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  25.65 
 
 		 395 aa  47  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  24.24 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  30.48 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  26.45 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.46 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4310  DNA polymerase IV  32.57 
 
 		 357 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2844  DNA polymerase IV  28.63 
 
 		 411 aa  46.6  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.900402  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  25.32 
 
 		 357 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  23.4 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  29.79 
 
 		 477 aa  45.8  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  24.14 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2249  hypothetical protein  27.85 
 
 		 569 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0732725  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2368  DNA-directed DNA polymerase  27.95 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  22.22 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2466  UMUC domain protein DNA-repair protein  32.59 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.666562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>