More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2905 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
502 aa  1025    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  45.53 
 
 
505 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  39.64 
 
 
521 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  43 
 
 
506 aa  358  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  39.17 
 
 
512 aa  354  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  42.07 
 
 
499 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.09 
 
 
513 aa  352  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  43.23 
 
 
510 aa  347  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.76 
 
 
514 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  43.15 
 
 
501 aa  343  4e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  39.61 
 
 
508 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  41.32 
 
 
506 aa  336  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  35.77 
 
 
514 aa  333  3e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  39.51 
 
 
516 aa  333  6e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  41.51 
 
 
500 aa  332  8e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  42.36 
 
 
508 aa  330  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  39.45 
 
 
521 aa  329  9e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  42.05 
 
 
506 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.65 
 
 
512 aa  326  5e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  38.58 
 
 
515 aa  325  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  39.42 
 
 
522 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  36.58 
 
 
518 aa  325  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  39.3 
 
 
511 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  38.67 
 
 
511 aa  320  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  36.55 
 
 
662 aa  319  7e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  40.33 
 
 
492 aa  318  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  36.93 
 
 
559 aa  317  3e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  36.6 
 
 
561 aa  317  3e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  38.04 
 
 
527 aa  315  9e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  38.2 
 
 
549 aa  315  9e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  39.52 
 
 
539 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  39.53 
 
 
509 aa  312  7.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  39.01 
 
 
520 aa  312  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  39.48 
 
 
500 aa  311  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.16 
 
 
510 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6769  AMP-dependent synthetase and ligase  40.78 
 
 
507 aa  310  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147424  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.77 
 
 
510 aa  309  8e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  38.59 
 
 
525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 
490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.57 
 
 
510 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.57 
 
 
510 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.57 
 
 
510 aa  307  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.57 
 
 
510 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.57 
 
 
510 aa  307  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.57 
 
 
510 aa  307  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.57 
 
 
510 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.57 
 
 
510 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.73 
 
 
561 aa  306  7e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.73 
 
 
582 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.73 
 
 
561 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  39.1 
 
 
519 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.73 
 
 
563 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.54 
 
 
563 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.54 
 
 
561 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.82 
 
 
510 aa  300  4e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.81 
 
 
561 aa  300  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.54 
 
 
582 aa  299  9e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.54 
 
 
563 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.54 
 
 
563 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 
498 aa  297  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 
566 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  34.52 
 
 
495 aa  296  5e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  38.38 
 
 
585 aa  296  7e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  37.34 
 
 
511 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0411  AMP-dependent synthetase and ligase  42.24 
 
 
513 aa  292  8e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  35.03 
 
 
557 aa  289  8e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 
565 aa  289  9e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.65 
 
 
561 aa  287  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  35.59 
 
 
549 aa  286  5.999999999999999e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  37.65 
 
 
508 aa  286  9e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 
569 aa  285  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 
525 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 
504 aa  283  7.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.99 
 
 
503 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 
583 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  37.6 
 
 
502 aa  281  3e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  37.22 
 
 
507 aa  279  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 
536 aa  279  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 
520 aa  278  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 
527 aa  278  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0413  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 
579 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496898 
 
 
-
 
NC_004310  BR0289  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 
554 aa  277  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883702  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0200  AMP-dependent synthetase and ligase  35.61 
 
 
566 aa  276  8e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366303  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  38.08 
 
 
510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  35.94 
 
 
549 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 
577 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 
506 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 
554 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0428  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 
579 aa  274  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0627658  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0303  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.21 
 
 
581 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  34.41 
 
 
599 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180137  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  35.02 
 
 
577 aa  273  5.000000000000001e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 
583 aa  273  6e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3995  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 
537 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000737641  normal  0.189989 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 
502 aa  272  9e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3792  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 
571 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  37.55 
 
 
510 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  36.76 
 
 
511 aa  270  5e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  34.18 
 
 
578 aa  270  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 
601 aa  269  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.455088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>