120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2789 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2789  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  726    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3506  protein of unknown function DUF1006  62.99 
 
 
359 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.862952  normal  0.204168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2334  hypothetical protein  55.92 
 
 
368 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1717  hypothetical protein  33.68 
 
 
408 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2950  hypothetical protein  33.81 
 
 
401 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4263  hypothetical protein  33.33 
 
 
404 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1435  hypothetical protein  33.94 
 
 
409 aa  159  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.434806  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00920  hypothetical protein  33.16 
 
 
410 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0550337  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2727  protein of unknown function DUF1006  33.16 
 
 
410 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1023  hypothetical protein  33.16 
 
 
410 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0437357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2680  hypothetical protein  33.16 
 
 
410 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.309321  normal  0.302456 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00927  hypothetical protein  33.16 
 
 
410 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0613112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1014  hypothetical protein  32.9 
 
 
410 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00266491  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1019  hypothetical protein  32.89 
 
 
410 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.871139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1051  hypothetical protein  32.63 
 
 
410 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2204  hypothetical protein  32.9 
 
 
410 aa  155  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0443538  normal  0.243717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2408  hypothetical protein  32.9 
 
 
410 aa  156  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173137  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2989  hypothetical protein  33.77 
 
 
416 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1077  hypothetical protein  32.64 
 
 
410 aa  153  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00717119  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1100  hypothetical protein  32.89 
 
 
410 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1084  hypothetical protein  32.71 
 
 
410 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.048603  normal  0.227981 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0847  hypothetical protein  32.88 
 
 
403 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4762  hypothetical protein  33.33 
 
 
403 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5418  hypothetical protein  32.13 
 
 
403 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0992  hypothetical protein  32.71 
 
 
410 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789138  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3498  hypothetical protein  31.88 
 
 
403 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4868  hypothetical protein  31.88 
 
 
403 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4239  hypothetical protein  31.55 
 
 
403 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  normal  0.240399 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3732  hypothetical protein  32.18 
 
 
466 aa  149  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.106276  normal  0.539223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3033  hypothetical protein  36.86 
 
 
405 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1754  hypothetical protein  34.46 
 
 
423 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1169  hypothetical protein  33.68 
 
 
409 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2233  hypothetical protein  33.68 
 
 
444 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0071  hypothetical protein  33.68 
 
 
444 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0046059  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0990  hypothetical protein  33.68 
 
 
444 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1548  hypothetical protein  33.68 
 
 
409 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0902  hypothetical protein  33.68 
 
 
416 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0891  protein of unknown function DUF1006  31.01 
 
 
388 aa  146  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27310  hypothetical protein  31.68 
 
 
402 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3291  hypothetical protein  29.63 
 
 
399 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.19754  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2311  hypothetical protein  32.21 
 
 
402 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2141  hypothetical protein  33.62 
 
 
406 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129516  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2137  hypothetical protein  32.12 
 
 
397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387118  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3991  hypothetical protein  31.61 
 
 
406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0568557  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2745  hypothetical protein  31.68 
 
 
450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2793  hypothetical protein  31.57 
 
 
393 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.585867  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2233  hypothetical protein  32.56 
 
 
407 aa  132  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00963796 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0254  hypothetical protein  32.04 
 
 
403 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0504  hypothetical protein  30.92 
 
 
399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0989166  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1587  hypothetical protein  28.83 
 
 
402 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.447524 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2043  hypothetical protein  31.87 
 
 
387 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4037  protein of unknown function DUF1006  32.8 
 
 
398 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3101  hypothetical protein  32.04 
 
 
394 aa  122  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0111647 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09390  hypothetical protein  31.95 
 
 
449 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4914  hypothetical protein  28.24 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0625  protein of unknown function DUF1006  29.48 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.045012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5817  protein of unknown function DUF1006  30.65 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1922  protein of unknown function DUF1006  30.42 
 
 
380 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.465239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0874  hypothetical protein  30.99 
 
 
494 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1440  hypothetical protein  30.75 
 
 
405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.179027 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4678  hypothetical protein  32.13 
 
 
415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1010  hypothetical protein  30.6 
 
 
397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1487  protein of unknown function DUF1006  30.25 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.839829  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4161  protein of unknown function DUF1006  31.96 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0584  protein of unknown function DUF1006  29.4 
 
 
411 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0292  hypothetical protein  29.25 
 
 
398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4332  hypothetical protein  29.28 
 
 
388 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4110  hypothetical protein  28.96 
 
 
390 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2209  hypothetical protein  28.49 
 
 
404 aa  116  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.266016  normal  0.263696 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0367  hypothetical protein  29.04 
 
 
388 aa  116  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3917  protein of unknown function DUF1006  28.66 
 
 
390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1418  hypothetical protein  31.2 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0272314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7587  protein of unknown function DUF1006  29.85 
 
 
401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0372  hypothetical protein  29.07 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3654  hypothetical protein  29.07 
 
 
388 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4016  hypothetical protein  28.66 
 
 
389 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6004  protein of unknown function DUF1006  27.4 
 
 
397 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3994  hypothetical protein  27.74 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2707  hypothetical protein  31.58 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.288749  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25310  hypothetical protein  30.1 
 
 
402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104816  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2438  protein of unknown function DUF1006  32.58 
 
 
413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1386  hypothetical protein  31.46 
 
 
410 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1439  hypothetical protein  32.32 
 
 
399 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1344  hypothetical protein  32.15 
 
 
409 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.471387  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2101  hypothetical protein  29.72 
 
 
404 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.149502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2114  hypothetical protein  29.72 
 
 
404 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.408029  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2160  hypothetical protein  29.72 
 
 
404 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2383  hypothetical protein  30.18 
 
 
411 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0214821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3948  protein of unknown function DUF1006  30.6 
 
 
403 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751345  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0997  hypothetical protein  30.75 
 
 
397 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.728779  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1245  protein of unknown function DUF1006  32.22 
 
 
402 aa  106  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2230  protein of unknown function DUF1006  31.11 
 
 
437 aa  106  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00678706  normal  0.39065 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08640  hypothetical protein  30.37 
 
 
441 aa  106  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00452751  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1055  hypothetical protein  30.55 
 
 
397 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2912  hypothetical protein  27.55 
 
 
406 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.260325  normal  0.218883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1021  hypothetical protein  29.72 
 
 
442 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3840  hypothetical protein  26.59 
 
 
402 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4005  hypothetical protein  30.62 
 
 
408 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0454091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2519  hypothetical protein  27.37 
 
 
389 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1058  protein of unknown function DUF1006  30.77 
 
 
397 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.338087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>