162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2767 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  100 
 
 
546 aa  1112    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  38.4 
 
 
506 aa  317  3e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  36.88 
 
 
515 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  38.88 
 
 
495 aa  293  4e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  36.83 
 
 
521 aa  293  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  38.48 
 
 
515 aa  293  7e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  37.04 
 
 
508 aa  292  8e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  34.77 
 
 
522 aa  292  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  36.64 
 
 
537 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  39.01 
 
 
525 aa  286  9e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  37.65 
 
 
541 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  37.07 
 
 
518 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  34.95 
 
 
500 aa  280  5e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  35.55 
 
 
485 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  35.8 
 
 
518 aa  273  6e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  36.47 
 
 
507 aa  272  9e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  35.2 
 
 
524 aa  272  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  35.71 
 
 
527 aa  272  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  35.28 
 
 
545 aa  267  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  33.4 
 
 
521 aa  263  8.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  35.21 
 
 
538 aa  261  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  36.32 
 
 
523 aa  259  9e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  34.46 
 
 
542 aa  253  7e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  32.72 
 
 
522 aa  248  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  34.15 
 
 
521 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  32.11 
 
 
511 aa  240  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  32.11 
 
 
511 aa  240  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  32.11 
 
 
511 aa  240  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  32.9 
 
 
542 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  32.92 
 
 
520 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  34.64 
 
 
533 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  34.64 
 
 
508 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  34.64 
 
 
508 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  32.29 
 
 
495 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  32.01 
 
 
525 aa  231  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  33.69 
 
 
551 aa  230  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  34.72 
 
 
520 aa  229  7e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  32.42 
 
 
540 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 
505 aa  221  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  31.88 
 
 
516 aa  220  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  33.06 
 
 
505 aa  216  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  32.68 
 
 
535 aa  213  7.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  31.74 
 
 
476 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  33.06 
 
 
535 aa  200  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  32.21 
 
 
571 aa  200  7e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  33.21 
 
 
557 aa  199  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  28.74 
 
 
504 aa  196  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  31.88 
 
 
518 aa  193  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  29.9 
 
 
499 aa  192  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  32.95 
 
 
506 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  29.96 
 
 
505 aa  183  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  30.69 
 
 
564 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  30.4 
 
 
555 aa  179  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  30.77 
 
 
499 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  32.19 
 
 
532 aa  179  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  30.39 
 
 
505 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  30.8 
 
 
539 aa  177  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  29.61 
 
 
544 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  29.6 
 
 
478 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  31.36 
 
 
530 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  28.84 
 
 
520 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  29.2 
 
 
504 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  29.06 
 
 
532 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  30.58 
 
 
484 aa  169  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  31.49 
 
 
551 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  30.13 
 
 
547 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  28.07 
 
 
486 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  29.2 
 
 
494 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  29.46 
 
 
542 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  28.92 
 
 
515 aa  163  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  29.01 
 
 
508 aa  161  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  29.9 
 
 
527 aa  158  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  30.37 
 
 
521 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  26.81 
 
 
750 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  28.79 
 
 
556 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  29.24 
 
 
504 aa  155  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  29.74 
 
 
536 aa  154  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  28.95 
 
 
493 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  27.8 
 
 
505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  29.13 
 
 
566 aa  148  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  29.64 
 
 
546 aa  146  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  25 
 
 
597 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2750  TAP domain-containing protein  29.27 
 
 
490 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51195  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  29.61 
 
 
522 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  24.65 
 
 
459 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  28.95 
 
 
514 aa  139  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 
525 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  25.92 
 
 
613 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  25.96 
 
 
475 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  28.07 
 
 
486 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02580  alpha/beta hydrolase family protein  27.08 
 
 
623 aa  123  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.978734  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  33.46 
 
 
300 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  29.14 
 
 
559 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2785  TAP domain protein  34.72 
 
 
480 aa  117  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6096  TAP domain protein  27.98 
 
 
557 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  36.53 
 
 
597 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  35.75 
 
 
643 aa  113  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3544  TAP domain protein  27.13 
 
 
524 aa  113  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000370838  hitchhiker  0.00997148 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  24.95 
 
 
519 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  25.59 
 
 
524 aa  104  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.494839 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>