More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2764 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2764  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  576  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.876324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  51.28 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  53.57 
 
 		 318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.35 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0619  hypothetical protein  53.51 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  55.34 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  48.35 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  44.88 
 
 		 324 aa  235  9e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.55 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  49.09 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  47.87 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  47.79 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.23 
 
 		 287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598398  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  48.75 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  46.38 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  46.38 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.52 
 
 		 290 aa  201  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.36 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  45.22 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.24 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  48.88 
 
 		 395 aa  189  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.12 
 
 		 291 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  43.98 
 
 		 288 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.69 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  42.8 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.67 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  41.96 
 
 		 272 aa  168  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.69 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0151  putative transmembrane protein  50.78 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0551496  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3677  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.49 
 
 		 285 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2455  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.02 
 
 		 362 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4245  hypothetical protein  37.45 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000122262  hitchhiker  0.00219233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4124  hypothetical protein  37.84 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0215  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.31 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000175088  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  33.56 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3499  hypothetical protein  37.69 
 
 		 285 aa  106  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0213  hypothetical protein  36.92 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3933  hypothetical protein  36.04 
 
 		 284 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000367698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3735  hypothetical protein  35.69 
 
 		 284 aa  96.3  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3806  hypothetical protein  35.69 
 
 		 284 aa  96.3  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.305382  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4527  integral membrane domain-containing protein  35.69 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3644  hypothetical protein  28.18 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0682  hypothetical protein  30.64 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.095942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003645  permease  30.99 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.436376  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3565  DMT family permease  27.46 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02200  hypothetical protein  31.31 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.79 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  28.52 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  31.79 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.41 
 
 		 367 aa  72.4  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.18 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  31.07 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  29.43 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2433  hypothetical protein  29.68 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21912  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  30.94 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  33.49 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  31.6 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  33.49 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  31.37 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1964  hypothetical protein  28.28 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.07 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  29.82 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  32.09 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  26.71 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0068  hypothetical protein  28.76 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  32.54 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.28 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  29.27 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  32.45 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  28 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  29.03 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.58 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  32.18 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  30.8 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  30.66 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  30.51 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  27.56 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  32.75 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  30.21 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  29.17 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.24 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  33.78 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  30.84 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  28.67 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0391  hypothetical protein  29.58 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  28.88 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  27.93 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  31.88 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>