More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2733 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
434 aa  873    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  53.5 
 
 
442 aa  458  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  44.78 
 
 
444 aa  322  6e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  37.47 
 
 
430 aa  252  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  36.43 
 
 
437 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  36.83 
 
 
424 aa  237  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  35.69 
 
 
424 aa  229  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  32.76 
 
 
446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  31.09 
 
 
467 aa  195  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  32.6 
 
 
452 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  32.84 
 
 
452 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  30.5 
 
 
421 aa  187  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 
424 aa  178  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 
421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  32.11 
 
 
457 aa  173  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
424 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  29.56 
 
 
421 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  30.47 
 
 
429 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  30.79 
 
 
410 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 
418 aa  156  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  30 
 
 
447 aa  152  8.999999999999999e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
438 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 
420 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 
424 aa  142  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  28.43 
 
 
455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  31.65 
 
 
449 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 
417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  31.75 
 
 
449 aa  129  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  30.83 
 
 
449 aa  129  7.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 
480 aa  126  7e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 
445 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 
434 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.17 
 
 
444 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.3 
 
 
450 aa  122  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.36 
 
 
453 aa  121  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 
438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.39 
 
 
458 aa  117  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  31.35 
 
 
504 aa  116  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 
456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 
430 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 
447 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 
428 aa  108  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 
438 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 
424 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 
440 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 
432 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  25.19 
 
 
437 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 
428 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.12 
 
 
416 aa  100  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.79 
 
 
426 aa  99  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 
439 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 
399 aa  96.7  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 
424 aa  96.3  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
462 aa  95.5  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 
434 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  30.35 
 
 
435 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  23.11 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
435 aa  93.6  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.21 
 
 
445 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 
411 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 
423 aa  90.1  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  28.04 
 
 
433 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 
433 aa  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 
420 aa  89.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.73 
 
 
450 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 
420 aa  87.8  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 
445 aa  87.8  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.57 
 
 
431 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 
445 aa  86.7  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 
443 aa  86.7  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 
434 aa  87  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 
410 aa  86.7  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  25.5 
 
 
432 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 
432 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 
432 aa  83.6  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 
432 aa  83.2  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 
402 aa  82.4  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.92 
 
 
431 aa  82  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
426 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 
455 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 
455 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 
427 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  23.82 
 
 
434 aa  80.5  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 
415 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 
440 aa  80.1  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 
488 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  27.58 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 
488 aa  80.1  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 
433 aa  79.7  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 
435 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 
430 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  28.57 
 
 
229 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  21.01 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 
433 aa  77  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 
426 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>