61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2720 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2720  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 368 aa  717    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.210642 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4262  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  56.68 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3871  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  56.68 
 
 		 362 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3043  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  54.22 
 
 		 376 aa  338  8e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178966  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1377  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  54.72 
 
 		 378 aa  337  2.9999999999999997e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5922  Uroporphyrinogen-III synthase-like protein  51.5 
 
 		 389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0915623  normal  0.0919141 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  51.63 
 
 		 391 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000567169  hitchhiker  0.00000562153 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10264  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  52.82 
 
 		 381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.122536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0793  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  53.51 
 
 		 383 aa  323  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2410  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  52.38 
 
 		 390 aa  323  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000187789  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0253  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  51.61 
 
 		 382 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.518626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0840  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  51.93 
 
 		 381 aa  314  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000157223  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0263  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  51.34 
 
 		 382 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169391  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0273  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  51.34 
 
 		 382 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92823  normal  0.27348 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0380  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  52.16 
 
 		 380 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0301  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  51.35 
 
 		 380 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3505  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  49.19 
 
 		 377 aa  299  4e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1494  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  50 
 
 		 383 aa  299  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  47.68 
 
 		 391 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0354  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  48.51 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1325  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  45.08 
 
 		 387 aa  260  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112832  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00840  uroporphyrinogen-III synthase  44.26 
 
 		 377 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0880377  normal  0.206146 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1742  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  45.72 
 
 		 435 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.849504 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1813  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  41.69 
 
 		 394 aa  236  4e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0320621  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2796  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  41.35 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0507836  decreased coverage  0.000543328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1775  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  41.76 
 
 		 369 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.488954  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2282  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  39.18 
 
 		 419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000232035  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2199  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.15 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1303  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  39.67 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000592794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1256  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  38.86 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1707  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.82 
 
 		 281 aa  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2335  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.2 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0052  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.27 
 
 		 261 aa  95.5  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0672  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.89 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947107 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2288  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.73 
 
 		 291 aa  87.8  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130767  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2640  uroporphyrinogen-III synthase  28.52 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1526  uroporphyrinogen-III synthase  26.64 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000060174  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4165  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.44 
 
 		 280 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1458  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.45 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5710  putative uroporphyrinogen-III synthase  25.94 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2963  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.14 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1109  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.12 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4563  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.64 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  30.83 
 
 		 515 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.25 
 
 		 513 aa  60.1  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1576  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.71 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1214  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.19 
 
 		 281 aa  53.1  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  28.09 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.36 
 
 		 509 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 231 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.27 
 
 		 519 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.8 
 
 		 234 aa  47.8  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.541096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2009  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  38.96 
 
 		 233 aa  47.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.406891  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.08 
 
 		 232 aa  47  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226813 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2393  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.89 
 
 		 277 aa  47  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1028  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.97 
 
 		 505 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1057  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.67 
 
 		 505 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681167 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.95 
 
 		 511 aa  44.3  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  27.76 
 
 		 513 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.69 
 
 		 510 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5151  response regulator receiver protein  37.35 
 
 		 330 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.347676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>