78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2698 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 
369 aa  755    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  59.94 
 
 
456 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  45.33 
 
 
505 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  37.54 
 
 
345 aa  186  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  33.11 
 
 
304 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  33.22 
 
 
348 aa  158  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  34.75 
 
 
306 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  34.88 
 
 
304 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  33.88 
 
 
495 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4511  glycoside hydrolase family protein  31.53 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  31.21 
 
 
472 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  27.76 
 
 
522 aa  93.6  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  31.62 
 
 
524 aa  92.8  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4087  glycoside hydrolase family 43  31.4 
 
 
357 aa  89.4  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  27.36 
 
 
310 aa  87.4  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3976  glycoside hydrolase family protein  25.58 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  29.56 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  26.11 
 
 
501 aa  80.1  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  26.38 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  26.43 
 
 
357 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  27.08 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  26.33 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  26.67 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  29.07 
 
 
315 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  25.47 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  26.46 
 
 
487 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  23.18 
 
 
325 aa  63.5  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 
465 aa  63.2  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  26.19 
 
 
472 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.24 
 
 
810 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  25.8 
 
 
341 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.6 
 
 
327 aa  60.1  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  28.31 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  29.41 
 
 
488 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  25.54 
 
 
338 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  27.49 
 
 
319 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.05 
 
 
379 aa  57  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  24.58 
 
 
344 aa  56.6  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  24.23 
 
 
313 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  26.69 
 
 
537 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  28.12 
 
 
491 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  24.05 
 
 
319 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  26.22 
 
 
315 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  24.61 
 
 
324 aa  52.8  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.35 
 
 
341 aa  52.8  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  24.03 
 
 
525 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  24.9 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  26.55 
 
 
497 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  25.32 
 
 
323 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.21 
 
 
344 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  23.43 
 
 
699 aa  50.4  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  29.81 
 
 
471 aa  49.7  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.49 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  24.1 
 
 
563 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  30.61 
 
 
581 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.37 
 
 
343 aa  47  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  31.9 
 
 
707 aa  46.6  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  27.27 
 
 
494 aa  46.6  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  27.93 
 
 
475 aa  46.6  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  23.65 
 
 
503 aa  46.6  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.47 
 
 
346 aa  46.6  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  27.93 
 
 
476 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  21.77 
 
 
540 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  22.79 
 
 
536 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  29.81 
 
 
471 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  36.21 
 
 
829 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  30.96 
 
 
472 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  28.97 
 
 
789 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  23.45 
 
 
543 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  23.6 
 
 
558 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  27.85 
 
 
401 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.27 
 
 
444 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.32 
 
 
357 aa  43.5  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  32.1 
 
 
327 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.7 
 
 
366 aa  43.5  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  31.34 
 
 
510 aa  43.1  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  24.57 
 
 
550 aa  42.7  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  24.12 
 
 
497 aa  42.7  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>