162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2660 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  100 
 
 
239 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  61.86 
 
 
240 aa  291  8e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  61.4 
 
 
240 aa  278  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  57.02 
 
 
236 aa  260  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  55.93 
 
 
237 aa  259  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  56.47 
 
 
235 aa  255  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  56.49 
 
 
238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  55.32 
 
 
236 aa  235  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  50.42 
 
 
272 aa  203  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  44.68 
 
 
235 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  46.91 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  45.29 
 
 
250 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  43.15 
 
 
238 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  41.6 
 
 
238 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  41.6 
 
 
238 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  42.04 
 
 
247 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  41.6 
 
 
238 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.27 
 
 
245 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  41.18 
 
 
238 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  44.2 
 
 
242 aa  153  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  46.15 
 
 
235 aa  150  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  41.77 
 
 
231 aa  148  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  44.12 
 
 
246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  37.89 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  37.89 
 
 
243 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  39.75 
 
 
250 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  41.89 
 
 
243 aa  138  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  38.77 
 
 
245 aa  138  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36.73 
 
 
251 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.44 
 
 
243 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  38.03 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.43 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  40.76 
 
 
270 aa  132  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.59 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.13 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.87 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  38.14 
 
 
744 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.4 
 
 
264 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.4 
 
 
264 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.17 
 
 
248 aa  122  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  39.61 
 
 
241 aa  122  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.52 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.78 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36.62 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  34.26 
 
 
240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  34.7 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  32.38 
 
 
262 aa  116  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  33.81 
 
 
243 aa  115  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  33.81 
 
 
243 aa  115  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  34.58 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  34.9 
 
 
272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  33.77 
 
 
248 aa  111  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  34.13 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.96 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  32.39 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.79 
 
 
218 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  33.96 
 
 
241 aa  108  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  34.07 
 
 
243 aa  108  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  34.2 
 
 
262 aa  107  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  40.59 
 
 
249 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  31.85 
 
 
243 aa  103  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  34.31 
 
 
264 aa  102  8e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  32.31 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  25.57 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  26.16 
 
 
492 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  32.28 
 
 
492 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  30.22 
 
 
512 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  27.07 
 
 
503 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  27.5 
 
 
506 aa  52.4  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  28.86 
 
 
501 aa  52  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1901  cobyric acid synthase  31.95 
 
 
480 aa  52  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.461706 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  32.17 
 
 
485 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  26.75 
 
 
507 aa  51.2  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  31.13 
 
 
495 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  30.86 
 
 
481 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  30.86 
 
 
481 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  27.75 
 
 
487 aa  49.3  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  26.95 
 
 
503 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  32.26 
 
 
484 aa  49.3  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  32.03 
 
 
507 aa  49.3  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0858  cobyric acid synthase CobQ  26.98 
 
 
465 aa  49.3  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.924146  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  35.4 
 
 
492 aa  48.9  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  31.36 
 
 
787 aa  48.5  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  33.08 
 
 
486 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  30.63 
 
 
489 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  32.54 
 
 
501 aa  48.5  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  30.33 
 
 
496 aa  48.5  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  33.58 
 
 
486 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  33.33 
 
 
545 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  28.36 
 
 
485 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1326  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  25.45 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000536393  hitchhiker  0.000591695 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  33.9 
 
 
532 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  33.33 
 
 
512 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  33.33 
 
 
585 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  34.43 
 
 
797 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5369  cobyric acid synthase  30.22 
 
 
491 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  33.33 
 
 
531 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  33.33 
 
 
523 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  33.33 
 
 
535 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  33.33 
 
 
529 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>