More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2649 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2649  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 399 aa  745    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  64.65 
 
 		 436 aa  457  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  65.96 
 
 		 409 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  60.56 
 
 		 386 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  57.36 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  54.62 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  59.59 
 
 		 404 aa  362  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  57.44 
 
 		 393 aa  352  5.9999999999999994e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  57.85 
 
 		 395 aa  351  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4657  sodium/hydrogen exchanger  59.69 
 
 		 436 aa  351  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  56.04 
 
 		 396 aa  332  6e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0119  sodium/hydrogen exchanger  55.26 
 
 		 401 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0118  sodium/hydrogen exchanger  57.26 
 
 		 401 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  52.19 
 
 		 388 aa  309  5e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2892  sodium/hydrogen exchanger  51.98 
 
 		 384 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2906  sodium/hydrogen exchanger  51.72 
 
 		 384 aa  289  7e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2862  sodium/hydrogen exchanger  51.72 
 
 		 384 aa  289  7e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2800  sodium/hydrogen exchanger  54.31 
 
 		 387 aa  276  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0408  sodium/hydrogen exchanger  50.51 
 
 		 388 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13265  integral membrane transport protein  49.73 
 
 		 385 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.53552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2651  sodium/hydrogen exchanger  50.41 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172671  decreased coverage  0.000202867 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19020  Kef-type K+ transport system, membrane component  50.41 
 
 		 415 aa  263  4e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  36.78 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  37.17 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  37.4 
 
 		 400 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  30.79 
 
 		 412 aa  166  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.37 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 		 407 aa  163  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.39 
 
 		 407 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  31.13 
 
 		 407 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  34.29 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.13 
 
 		 407 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  31.13 
 
 		 407 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.13 
 
 		 407 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.39 
 
 		 399 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  0.000000129264 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.39 
 
 		 399 aa  159  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  32.47 
 
 		 399 aa  159  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  32.73 
 
 		 399 aa  159  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.88 
 
 		 407 aa  159  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.23 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.56 
 
 		 399 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  32.47 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.56 
 
 		 399 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.47 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3609399999999994e-21 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  34.11 
 
 		 408 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.13 
 
 		 399 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.94 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.94 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  34.15 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  34.83 
 
 		 414 aa  149  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  29.8 
 
 		 400 aa  146  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  33.66 
 
 		 411 aa  143  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  33.12 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  31.23 
 
 		 585 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  29.59 
 
 		 586 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  29.82 
 
 		 586 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  32.8 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000156939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  30.87 
 
 		 586 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  29.89 
 
 		 585 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  29.93 
 
 		 587 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  30.38 
 
 		 585 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.67 
 
 		 587 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 673 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  30.81 
 
 		 585 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  29.12 
 
 		 586 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.93 
 
 		 587 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  30.38 
 
 		 585 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 		 747 aa  112  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  27.65 
 
 		 745 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  30.96 
 
 		 652 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  31.68 
 
 		 563 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  31.48 
 
 		 671 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  28.46 
 
 		 666 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  29.11 
 
 		 648 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  29.11 
 
 		 648 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  29.11 
 
 		 648 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0891  sodium/hydrogen exchanger  30.72 
 
 		 381 aa  109  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.155242  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.49 
 
 		 588 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  27.81 
 
 		 741 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  28.53 
 
 		 782 aa  107  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  29.08 
 
 		 648 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.5 
 
 		 572 aa  107  4e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  27.99 
 
 		 391 aa  107  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000544506  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  28.3 
 
 		 757 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  31.06 
 
 		 567 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  31 
 
 		 662 aa  106  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1796  sodium/hydrogen exchanger  31.58 
 
 		 585 aa  106  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240603 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  27.78 
 
 		 649 aa  106  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0387  sodium/hydrogen exchanger  31.92 
 
 		 565 aa  106  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  29.19 
 
 		 648 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  26.85 
 
 		 586 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  30 
 
 		 650 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  29.59 
 
 		 653 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  31.06 
 
 		 568 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1156  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  29.83 
 
 		 595 aa  103  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.269314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4976  potassium efflux system protein  33.17 
 
 		 607 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  30.71 
 
 		 562 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  29.14 
 
 		 563 aa  103  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  29.21 
 
 		 562 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  31.55 
 
 		 575 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.769555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>