117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2648 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  100 
 
 		 160 aa  314  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  65.62 
 
 		 160 aa  204  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  62.5 
 
 		 160 aa  199  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  58.75 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  64.38 
 
 		 160 aa  187  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  60 
 
 		 160 aa  183  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  58.75 
 
 		 160 aa  175  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  52.5 
 
 		 166 aa  167  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  56.33 
 
 		 196 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  56.33 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  51.25 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  51.25 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  51.25 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  53.5 
 
 		 161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  50.62 
 
 		 160 aa  153  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  52 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  46.25 
 
 		 195 aa  145  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  45 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  48.12 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  43.12 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  46.84 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  45.91 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  31.68 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  32.7 
 
 		 164 aa  94  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  31.45 
 
 		 164 aa  91.3  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  31.76 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  31.48 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  31.48 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  31.48 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  31.48 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  30.86 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  30.86 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  30.86 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  29.63 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  30.86 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  30.86 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  30.86 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  32.1 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  31.54 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  31.54 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  30.87 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  29.7 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  28.93 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  32.1 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  29.09 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  30 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  30 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  30 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  30 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  30 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  31.68 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  28.57 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  31.13 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6030  hypothetical protein  41.98 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176794  normal  0.984792 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  30.49 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0085  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  40.24 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  31.29 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0601  hypothetical protein  38.37 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0579  hypothetical protein  38.37 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  44.07 
 
 		 652 aa  58.2  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  33.05 
 
 		 673 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  31.4 
 
 		 674 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  39.13 
 
 		 662 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2691  hypothetical protein  24.84 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.392596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  40.91 
 
 		 668 aa  52.4  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  38.82 
 
 		 671 aa  52  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  37.33 
 
 		 693 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 		 676 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  24.26 
 
 		 335 aa  51.2  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  37.35 
 
 		 664 aa  50.8  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  22.07 
 
 		 341 aa  50.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  31.18 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  37.14 
 
 		 720 aa  47.4  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2589  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  23.53 
 
 		 335 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  23.53 
 
 		 335 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  45.1 
 
 		 544 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  34.78 
 
 		 771 aa  45.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  32.47 
 
 		 350 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  30.99 
 
 		 212 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1689  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  44.3  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  30.77 
 
 		 682 aa  44.3  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  32.76 
 
 		 220 aa  44.3  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  32.76 
 
 		 220 aa  44.3  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  34.48 
 
 		 684 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  31.34 
 
 		 672 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0356  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1552  TrkA domain-containing protein  27.1 
 
 		 400 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.724565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  29.85 
 
 		 666 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.85 
 
 		 697 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1361  TrkA domain-containing protein  28.33 
 
 		 208 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00515151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  33.82 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  33.82 
 
 		 710 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  27.05 
 
 		 542 aa  43.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  33.82 
 
 		 221 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  33.82 
 
 		 221 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  33.82 
 
 		 221 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  33.93 
 
 		 233 aa  42.4  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1615  TrkA domain-containing protein  28.33 
 
 		 208 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0410032  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  28.85 
 
 		 222 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>