More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2647 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  100 
 
 		 120 aa  244  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  66.67 
 
 		 123 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3287  thioredoxin  65.25 
 
 		 123 aa  168  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  64.96 
 
 		 123 aa  167  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24970  thioredoxin  64.35 
 
 		 126 aa  165  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  67.5 
 
 		 126 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1297  thioredoxin  70.43 
 
 		 130 aa  164  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0320053  normal  0.47539 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  61.02 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  64.29 
 
 		 126 aa  161  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  62.71 
 
 		 123 aa  161  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  62.93 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0362  thioredoxin  63.48 
 
 		 127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.125249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  61.02 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  63.79 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  60 
 
 		 117 aa  157  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  59.17 
 
 		 120 aa  157  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2026  thioredoxin  60.71 
 
 		 139 aa  156  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.12861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  55.93 
 
 		 131 aa  156  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  57.5 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  59.48 
 
 		 120 aa  155  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  58.26 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0368  thioredoxin  58.33 
 
 		 123 aa  154  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  63.64 
 
 		 120 aa  155  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  62.07 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  55.83 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  63.39 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  58.47 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  56.9 
 
 		 124 aa  150  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  56.9 
 
 		 125 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14050  thioredoxin  59.48 
 
 		 122 aa  150  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01500  thioredoxin  60.71 
 
 		 153 aa  150  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  55.46 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  57.63 
 
 		 124 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  54.24 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  57.63 
 
 		 124 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  57.63 
 
 		 124 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  55.83 
 
 		 125 aa  148  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  54.24 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  55 
 
 		 125 aa  147  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  54.24 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  61.47 
 
 		 122 aa  147  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  58.26 
 
 		 123 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1900  thioredoxin domain-containing protein  54.24 
 
 		 125 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0850569  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0609  thioredoxin  55.65 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1561  thioredoxin  58.26 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  51.69 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  57.27 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  53.45 
 
 		 125 aa  140  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  51.69 
 
 		 123 aa  140  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5392  thioredoxin  50.85 
 
 		 123 aa  140  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  51.69 
 
 		 123 aa  140  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3837  thioredoxin  60 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  61.67 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  50 
 
 		 123 aa  134  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0303  thioredoxin  53.91 
 
 		 126 aa  133  8e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  59.65 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  59.65 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  58.77 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  56.67 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  53.21 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  50.98 
 
 		 124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  39.17 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1619  thioredoxin  39.29 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000289203  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0564  thioredoxin  39.29 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.21989e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  38.33 
 
 		 120 aa  103  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1828  thioredoxin-related  42.86 
 
 		 124 aa  100  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00237221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1185  thioredoxin-related  41.38 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0751428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  48.48 
 
 		 170 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  45.71 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  44.76 
 
 		 178 aa  96.7  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11498  thioredoxin trxA  44.23 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000146148  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  47.47 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  47.47 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  47.47 
 
 		 170 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2251  Thioredoxin domain protein  41.96 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.32893  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  46.53 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  46.53 
 
 		 140 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0356  thioredoxin  40 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  43.43 
 
 		 133 aa  92  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  45.54 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  42.72 
 
 		 140 aa  90.9  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  42 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4942  thioredoxin  44.9 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  44.79 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  43.88 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5069  thioredoxin  43.88 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  40 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  44.44 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  39.22 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  43.43 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0397  thioredoxin  42.42 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  40.62 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5119  thioredoxin  44.9 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  41.18 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  43.3 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  43.3 
 
 		 140 aa  84.7  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  44.12 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  41.18 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  41.18 
 
 		 106 aa  84.3  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  44.12 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>