186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2640 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
187 aa  381  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  55.68 
 
 
186 aa  224  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  49.19 
 
 
177 aa  170  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.79 
 
 
193 aa  170  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  46.77 
 
 
183 aa  168  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  48.92 
 
 
186 aa  167  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  48.91 
 
 
187 aa  165  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  49.21 
 
 
193 aa  164  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.31 
 
 
186 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3842  bifunctional deaminase-reductase-like protein  50.27 
 
 
185 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  47.28 
 
 
182 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  42.78 
 
 
180 aa  148  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.44 
 
 
179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  44.94 
 
 
177 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  44.94 
 
 
177 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  43.4 
 
 
173 aa  130  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  44.3 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  45.34 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.43 
 
 
181 aa  125  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.14 
 
 
183 aa  122  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25060  dihydrofolate reductase  46.63 
 
 
193 aa  118  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  29.21 
 
 
172 aa  94  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.24 
 
 
184 aa  87.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  27.47 
 
 
173 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  27.32 
 
 
174 aa  85.1  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  27.32 
 
 
173 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.43 
 
 
184 aa  84  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  27.03 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.11 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  27.32 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  26.67 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.26 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  31.43 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  26.11 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  26.11 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.8 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  31.77 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  26.11 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  26.2 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  25 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.32 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  36.48 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  30.85 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  29.12 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  32.43 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  34.62 
 
 
173 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  25.93 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.12 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  27.47 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  32.03 
 
 
177 aa  62  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  27.59 
 
 
175 aa  61.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.48 
 
 
176 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  25.93 
 
 
173 aa  58.9  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.17 
 
 
185 aa  58.9  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  24.86 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.46 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.13 
 
 
180 aa  55.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  28.49 
 
 
213 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  31.09 
 
 
195 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.47 
 
 
212 aa  55.1  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  30.94 
 
 
215 aa  54.7  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  27.89 
 
 
390 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  23.68 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  27.32 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.95 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  24.34 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  23.81 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.47 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  29.44 
 
 
177 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  29.44 
 
 
177 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1275  deaminase-reductase domain-containing protein  32.39 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  29.15 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  27.67 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.47 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.85 
 
 
182 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.39 
 
 
175 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  27.39 
 
 
178 aa  52.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  27.67 
 
 
183 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  29.29 
 
 
199 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.81 
 
 
181 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  28.27 
 
 
177 aa  51.2  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0434  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.12 
 
 
214 aa  51.2  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.63 
 
 
214 aa  51.2  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.67 
 
 
183 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  27.61 
 
 
183 aa  51.2  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.11 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2465  bifunctional deaminase-reductase-like  30.6 
 
 
214 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293651  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.23 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  29.23 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.26 
 
 
240 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  28.57 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  22.63 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  22.4 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  26.6 
 
 
180 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.58 
 
 
220 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.14 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  26.42 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  28.19 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.11 
 
 
189 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>