More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2584 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
402 aa  745    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  46.26 
 
 
407 aa  275  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  41.16 
 
 
406 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  41.35 
 
 
412 aa  262  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  45.8 
 
 
402 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  44.8 
 
 
390 aa  242  9e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  47.63 
 
 
735 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  41.13 
 
 
399 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  38.97 
 
 
397 aa  234  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  41.25 
 
 
398 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  38.95 
 
 
408 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  39.41 
 
 
415 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  39.71 
 
 
415 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  40.58 
 
 
394 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  38.95 
 
 
408 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  38.12 
 
 
418 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  41.1 
 
 
392 aa  219  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  38.95 
 
 
408 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  38.75 
 
 
401 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  35.29 
 
 
404 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  38.4 
 
 
413 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  43.56 
 
 
410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  43.51 
 
 
397 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  43.98 
 
 
390 aa  212  9e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  39.28 
 
 
397 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  37.75 
 
 
422 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  36.87 
 
 
401 aa  201  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 
403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  36.66 
 
 
403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  37.14 
 
 
403 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  38.11 
 
 
404 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 
387 aa  192  6e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  36.83 
 
 
404 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  37.15 
 
 
403 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  37.24 
 
 
379 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  37.43 
 
 
400 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  37.15 
 
 
400 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  36.54 
 
 
399 aa  189  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  35.11 
 
 
400 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  34.15 
 
 
397 aa  187  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  35.85 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  36.81 
 
 
403 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  36.81 
 
 
403 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  34.2 
 
 
402 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  32.44 
 
 
397 aa  182  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  34.33 
 
 
451 aa  183  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  34.33 
 
 
451 aa  183  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  34.33 
 
 
451 aa  183  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  34.33 
 
 
451 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  34.33 
 
 
412 aa  182  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  36.17 
 
 
399 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  34.33 
 
 
451 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  34.25 
 
 
394 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  33.69 
 
 
396 aa  180  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  33.61 
 
 
404 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  32.98 
 
 
398 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  33.62 
 
 
400 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 
410 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 
407 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  31.75 
 
 
410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  36.09 
 
 
399 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  35.55 
 
 
395 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  33.43 
 
 
398 aa  170  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 
402 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22240  arabinose efflux permease family protein  36.41 
 
 
409 aa  169  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  33.06 
 
 
420 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  32.38 
 
 
396 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  34.77 
 
 
404 aa  168  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  32.55 
 
 
396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  31.66 
 
 
402 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  32.38 
 
 
396 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  32.38 
 
 
396 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  32.38 
 
 
396 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  33.69 
 
 
396 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  33.25 
 
 
402 aa  166  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  33.24 
 
 
396 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  33.63 
 
 
407 aa  166  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  30.54 
 
 
399 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  38.85 
 
 
403 aa  162  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  32.18 
 
 
407 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 
411 aa  162  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  32.6 
 
 
402 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  33.5 
 
 
415 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  34.01 
 
 
404 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  32.76 
 
 
404 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  34.4 
 
 
404 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  30.62 
 
 
396 aa  159  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  31 
 
 
404 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  31 
 
 
404 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  31 
 
 
404 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  31 
 
 
404 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  33.25 
 
 
415 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  33 
 
 
404 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
403 aa  158  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  31 
 
 
404 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  31 
 
 
404 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  33.25 
 
 
404 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  32.32 
 
 
397 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  30.79 
 
 
402 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>