More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2579 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 213 aa  414  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  64.59 
 
 		 207 aa  254  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 209 aa  235  4e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.29 
 
 		 209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.1 
 
 		 222 aa  232  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.02 
 
 		 211 aa  230  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.24 
 
 		 211 aa  229  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  57.35 
 
 		 217 aa  225  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.24 
 
 		 216 aa  225  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  59.9 
 
 		 214 aa  221  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  60.68 
 
 		 207 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.43 
 
 		 212 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  57 
 
 		 212 aa  218  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4922  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.77 
 
 		 206 aa  218  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0302523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.59 
 
 		 210 aa  204  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.56 
 
 		 211 aa  202  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.11 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  52.91 
 
 		 207 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.59 
 
 		 212 aa  198  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.11 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  56.25 
 
 		 205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  52.17 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.77 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.44 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  48.79 
 
 		 207 aa  184  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.04 
 
 		 213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3632  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.46 
 
 		 209 aa  181  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00835522  normal  0.0174868 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.08 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1102  LuxR family DNA-binding response regulator  41.98 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4147  two component LuxR family transcriptional regulator  52.47 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18530  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.71 
 
 		 209 aa  173  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2881  response regulator receiver  48.11 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00126066  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0485  two component LuxR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0855535  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.05 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.6 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.79 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 228 aa  169  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0642  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.48 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.78 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 226 aa  168  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  43.52 
 
 		 218 aa  168  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 224 aa  167  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  45.5 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.37 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  43.61 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 215 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.94 
 
 		 217 aa  164  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  43 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.6 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.33 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  43.26 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.37 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  43.26 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.48 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  43.26 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  43.26 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  43.26 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  43.26 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  43.26 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  45.66 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  43.26 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.58 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.96 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.74 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4183  two component LuxR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.65 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08490  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.07 
 
 		 236 aa  157  8e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199706  normal  0.526513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 235 aa  157  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.05 
 
 		 217 aa  157  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.34 
 
 		 231 aa  157  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  40.1 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 218 aa  156  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1746  response regulator receiver protein  45.58 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.56 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1284  two component LuxR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 209 aa  156  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.91 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.95 
 
 		 261 aa  155  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 242 aa  154  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  46.08 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  42.33 
 
 		 217 aa  154  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>