More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2560 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  390  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  53.37 
 
 		 195 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 210 aa  191  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  48.42 
 
 		 195 aa  174  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  48.13 
 
 		 193 aa  167  9e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  51.04 
 
 		 195 aa  155  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  32.26 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  37.95 
 
 		 243 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 243 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2160  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 242 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 243 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 224 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 203 aa  97.8  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 205 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  29.38 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  27.53 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  26.18 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  33.9 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  28.31 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0612  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  25.16 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  24.53 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.37 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  31.37 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.37 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.37 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.37 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2200  putative regulatory protein TetR  27.23 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.841471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  31.37 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  37.27 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 244 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3704  regulatory protein TetR  22.67 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>