More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2544 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  751    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  54.15 
 
 
366 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  55.75 
 
 
385 aa  350  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  52.87 
 
 
386 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  52.87 
 
 
386 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  52.87 
 
 
386 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  51.43 
 
 
368 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  53.47 
 
 
385 aa  342  7e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  52.31 
 
 
373 aa  342  8e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  51.15 
 
 
373 aa  341  1e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  53.94 
 
 
398 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  52.44 
 
 
397 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  53.85 
 
 
368 aa  334  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  51.92 
 
 
374 aa  334  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  53.37 
 
 
369 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  49.62 
 
 
386 aa  330  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  51.84 
 
 
381 aa  323  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  53.12 
 
 
389 aa  322  7e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  46.9 
 
 
425 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  47.21 
 
 
357 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  49.49 
 
 
390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  53.08 
 
 
380 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  52.42 
 
 
363 aa  308  9e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  49.74 
 
 
372 aa  306  3e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  49.36 
 
 
370 aa  286  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  38.92 
 
 
367 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  46.09 
 
 
372 aa  273  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  44.05 
 
 
421 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  43.77 
 
 
356 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  52.3 
 
 
483 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  42.65 
 
 
433 aa  256  7e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  50 
 
 
266 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  40.55 
 
 
389 aa  227  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  43.31 
 
 
402 aa  224  2e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  38.9 
 
 
369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  41.21 
 
 
360 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  38.92 
 
 
375 aa  202  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  41.27 
 
 
376 aa  200  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  38.59 
 
 
323 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  37.7 
 
 
342 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  36.34 
 
 
340 aa  183  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  35.41 
 
 
388 aa  176  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  36.71 
 
 
318 aa  164  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  33.9 
 
 
340 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  34.71 
 
 
370 aa  159  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  50.51 
 
 
338 aa  158  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  41.22 
 
 
240 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  33.81 
 
 
345 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  35.1 
 
 
341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  33.9 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  43.41 
 
 
244 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  42.93 
 
 
248 aa  152  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  33.05 
 
 
340 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  34.82 
 
 
341 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  30 
 
 
372 aa  149  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  34.55 
 
 
338 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  31.27 
 
 
346 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  30.98 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  34.27 
 
 
453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  35.79 
 
 
341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  34.82 
 
 
339 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  33.9 
 
 
343 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  34.82 
 
 
343 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  34.82 
 
 
343 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  33.9 
 
 
343 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  35.79 
 
 
341 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  35.79 
 
 
341 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  35.52 
 
 
342 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  30.38 
 
 
398 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  34.97 
 
 
341 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  35.52 
 
 
341 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  35.52 
 
 
341 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  33.07 
 
 
402 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  46.79 
 
 
225 aa  141  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  43.01 
 
 
250 aa  139  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  33.99 
 
 
342 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  30.18 
 
 
353 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  28.9 
 
 
400 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  34.68 
 
 
315 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  30.49 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  51.27 
 
 
228 aa  137  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  31.94 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  31.71 
 
 
362 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  33.7 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  31.4 
 
 
365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  45.86 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  31.11 
 
 
332 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  45.86 
 
 
306 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  34.19 
 
 
357 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  32.17 
 
 
341 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  45.3 
 
 
306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  32.02 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  25.39 
 
 
379 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  33.43 
 
 
329 aa  130  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  32.08 
 
 
382 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  39.56 
 
 
233 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  29.43 
 
 
376 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  33.89 
 
 
343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  31.86 
 
 
340 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  27.78 
 
 
389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>