More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2506 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 219 aa  443  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  50.52 
 
 		 215 aa  204  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 220 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  44.33 
 
 		 210 aa  144  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  41.88 
 
 		 203 aa  144  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 206 aa  144  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  41.12 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  132  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 198 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  37.57 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  38.58 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 205 aa  119  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 193 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 194 aa  95.1  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  88.6  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 187 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 187 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0463  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 193 aa  84.7  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3055  transcriptional regulator, TetR family  35.08 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  48.57 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 245 aa  62  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  30.66 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  56 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  45.76 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10262  hypothetical protein  25.58 
 
 		 151 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.277133  normal  0.125869 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1746  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227148  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>