More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2404 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2732  small GTP-binding protein  56.98 
 
 		 696 aa  724    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2107  elongation factor G  62.98 
 
 		 741 aa  662    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000230841  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0290  small GTP-binding protein  50.8 
 
 		 770 aa  691    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6127  elongation factor G  60.98 
 
 		 710 aa  845    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220969  normal  0.933466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3802  elongation factor G  52.45 
 
 		 729 aa  713    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.812471  normal  0.705979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2340  elongation factor G  60 
 
 		 729 aa  835    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.468158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1361  elongation factor G  53 
 
 		 722 aa  698    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1785  elongation factor G  69.32 
 
 		 717 aa  1033    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2404  small GTP-binding protein  100 
 
 		 718 aa  1454    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136608  normal  0.0116105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5517  elongation factor G  58.52 
 
 		 713 aa  797    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.469673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2099  small GTP-binding protein  61.51 
 
 		 719 aa  895    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00285281  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5136  elongation factor G  58.52 
 
 		 713 aa  797    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674006  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0872  elongation factor G  61.99 
 
 		 722 aa  840    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10121  elongation factor G  59.41 
 
 		 714 aa  817    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2028  elongation factor G  61.15 
 
 		 726 aa  857    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521312  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  61.72 
 
 		 708 aa  903    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  59.52 
 
 		 719 aa  861    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1772  elongation factor G  69.74 
 
 		 717 aa  1040    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228015  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4599  elongation factor G  55.9 
 
 		 701 aa  766    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.463727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5225  elongation factor G  58.52 
 
 		 713 aa  797    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.526168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5155  elongation factor G  55.76 
 
 		 674 aa  710    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212266  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  37.32 
 
 		 695 aa  494  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  36.32 
 
 		 696 aa  477  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  38.97 
 
 		 680 aa  476  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  37.28 
 
 		 682 aa  477  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  34.75 
 
 		 692 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  37.14 
 
 		 679 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  35.81 
 
 		 696 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  35.52 
 
 		 696 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  34.87 
 
 		 695 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1453  elongation factor G  40.26 
 
 		 677 aa  462  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259372  normal  0.118188 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  37.14 
 
 		 673 aa  463  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  39.6 
 
 		 690 aa  461  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  35.61 
 
 		 691 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  34.78 
 
 		 694 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  35.42 
 
 		 667 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  36.64 
 
 		 683 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  34.88 
 
 		 682 aa  443  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  35.25 
 
 		 673 aa  442  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  37.86 
 
 		 693 aa  445  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  34.19 
 
 		 697 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2098  small GTP-binding protein  37.48 
 
 		 656 aa  439  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  34.19 
 
 		 697 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  35.59 
 
 		 692 aa  434  1e-120  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  35.3 
 
 		 696 aa  434  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  34.38 
 
 		 670 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  35.14 
 
 		 694 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  35.97 
 
 		 686 aa  429  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  33.29 
 
 		 697 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  35.53 
 
 		 683 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  36.57 
 
 		 687 aa  430  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  37.38 
 
 		 701 aa  427  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  34.61 
 
 		 692 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  33.43 
 
 		 701 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  33.29 
 
 		 694 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  36.31 
 
 		 701 aa  423  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.35 
 
 		 682 aa  423  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  33.29 
 
 		 701 aa  425  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  37.23 
 
 		 701 aa  419  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  34.09 
 
 		 694 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  33.04 
 
 		 683 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  33.43 
 
 		 685 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04690  small GTP-binding protein domain protein  36.35 
 
 		 681 aa  415  1e-114  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  36.9 
 
 		 703 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  34.86 
 
 		 697 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4111  small GTP-binding protein  35.53 
 
 		 697 aa  409  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902379 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  35.88 
 
 		 707 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  35.86 
 
 		 691 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  35.39 
 
 		 686 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  35.24 
 
 		 692 aa  405  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  34.19 
 
 		 698 aa  404  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000382661  hitchhiker  0.00000123904 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  32.9 
 
 		 683 aa  405  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  34.96 
 
 		 697 aa  405  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3227  small GTP-binding protein  38.89 
 
 		 683 aa  402  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.717315  normal  0.0158872 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  33.62 
 
 		 691 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  33.1 
 
 		 690 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0717  small GTP-binding protein  33.14 
 
 		 696 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  35.44 
 
 		 685 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2121  small GTP-binding protein  36.23 
 
 		 658 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  33.43 
 
 		 688 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  33.77 
 
 		 691 aa  399  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  31.99 
 
 		 693 aa  399  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  34.81 
 
 		 707 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  33.47 
 
 		 691 aa  398  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  32.44 
 
 		 691 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3402  elongation factor G  35.59 
 
 		 730 aa  395  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312369 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  34.87 
 
 		 686 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2690  elongation factor G  32.62 
 
 		 691 aa  392  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3702  small GTP-binding protein  36.22 
 
 		 687 aa  395  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.805436  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  32.95 
 
 		 689 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  32.47 
 
 		 697 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  32.18 
 
 		 685 aa  395  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  32.57 
 
 		 689 aa  391  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  33.19 
 
 		 701 aa  391  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  32.81 
 
 		 703 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  34.05 
 
 		 692 aa  392  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  33.29 
 
 		 691 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  34.23 
 
 		 698 aa  392  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  33.81 
 
 		 693 aa  390  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  31.48 
 
 		 692 aa  391  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>