More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2354 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2354  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  100 
 
 
259 aa  519  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1103  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  69.11 
 
 
259 aa  371  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0274897  normal  0.0559611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1210  electron transfer flavoprotein beta-subunit  67.95 
 
 
259 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4092  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  64.86 
 
 
259 aa  332  4e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0593  electron transfer flavoprotein, beta subunit  56.76 
 
 
259 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28260  electron transfer flavoprotein, beta subunit  54.83 
 
 
261 aa  281  9e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2846  electron transfer flavoprotein subunits alpha/beta  55.6 
 
 
259 aa  280  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6051  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  54.44 
 
 
259 aa  278  6e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0256  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  54.44 
 
 
259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0672629  normal  0.0851543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3575  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  54.44 
 
 
259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8114  electron transfer flavoprotein beta-subunit  54.83 
 
 
259 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673435 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3260  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  51.35 
 
 
261 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1438  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  51.74 
 
 
260 aa  260  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0597474  normal  0.920137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1074  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  50.19 
 
 
280 aa  257  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250999  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4259  electron transfer flavoprotein beta-subunit  50.19 
 
 
263 aa  256  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3659  electron transfer flavoprotein beta-subunit  51.34 
 
 
261 aa  255  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2099  electron transfer flavoprotein beta-subunit  49.81 
 
 
263 aa  255  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1297  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  52.51 
 
 
259 aa  251  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1850  electron transfer flavoprotein beta-subunit  49.62 
 
 
266 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1870  electron transfer flavoprotein beta-subunit  49.62 
 
 
266 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244311  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2917  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  49.81 
 
 
261 aa  250  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0846128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1916  electron transfer flavoprotein beta-subunit  49.62 
 
 
266 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0359178  normal  0.444862 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13045  electron transfer flavoprotein beta subunit fixA  46.97 
 
 
266 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000726772  hitchhiker  0.00331196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1815  electron transfer flavoprotein beta-subunit  47.57 
 
 
266 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.48954  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1102  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  48.3 
 
 
264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  hitchhiker  0.00234643 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0640  electron transfer flavoprotein beta-subunit  46.07 
 
 
266 aa  218  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09600  electron transfer flavoprotein, beta subunit  46.97 
 
 
262 aa  218  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0670453  normal  0.0687461 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2465  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  47.55 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000280945 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0684  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.38 
 
 
260 aa  211  7e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.965438 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2742  electron transfer flavoprotein beta-subunit  45.56 
 
 
270 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3679  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  45.42 
 
 
262 aa  205  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1041  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  45 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1725  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  39.03 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.363421  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0657  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.33 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.735589  normal  0.553142 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0353  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  42.47 
 
 
251 aa  176  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2412  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  41.11 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.431596  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02780  electron transfer flavoprotein, beta subunit  42.15 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10410  electron transfer flavoprotein, beta subunit  40.52 
 
 
268 aa  172  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4640  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  41.3 
 
 
263 aa  172  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0673923 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1346  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.73 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.598656  normal  0.625281 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0655  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  40 
 
 
258 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2285  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.86 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2583  electron transfer flavoprotein, beta subunit/FixA family protein  35.86 
 
 
259 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1432  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  35.25 
 
 
255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2862  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.55 
 
 
257 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2472  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  39.23 
 
 
258 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.55 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4535  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.36 
 
 
260 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0741133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3648  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.58 
 
 
257 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1383  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.16 
 
 
260 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0058  electron transfer flavoprotein subunit beta  36.99 
 
 
267 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001045 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3687  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.54 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1545  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.97 
 
 
261 aa  139  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0106  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.51 
 
 
266 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0571766  normal  0.27576 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1778  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.19 
 
 
255 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1880  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.36 
 
 
262 aa  136  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.190196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3038  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.02 
 
 
286 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1538  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.61 
 
 
265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.374456  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  39.3 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3300  electron transfer flavoprotein subunit beta  35.21 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2626  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.5 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1591  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  35.94 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1077  electron transfer flavoprotein, beta subunit  33.93 
 
 
261 aa  133  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.210239 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2776  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.12 
 
 
277 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000336538  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4830  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  41.2 
 
 
263 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1935  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  30.27 
 
 
266 aa  131  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988046  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1601  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.6 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  37.55 
 
 
257 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.315122 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2748  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.18 
 
 
249 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2950  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.14 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1495  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3236  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.6 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.654108 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1608  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.91 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3223  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.5 
 
 
257 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3077  electron transfer flavoprotein subunit beta  34.24 
 
 
249 aa  125  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1713  electron transfer flavoprotein subunit beta  33.6 
 
 
258 aa  125  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2556  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.45 
 
 
253 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629709  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4351  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2363  electron transfer flavoprotein beta-subunit  36.1 
 
 
249 aa  125  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4419  electron transfer flavoprotein subunit beta  36.5 
 
 
257 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4760  electron transfer flavoprotein subunit beta  36.5 
 
 
257 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4650  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36 
 
 
257 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4631  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36 
 
 
257 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00479771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4270  electron transfer flavoprotein, beta subunit (beta-ETF)  36 
 
 
257 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1698  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  38.39 
 
 
255 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.214951  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0604  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36 
 
 
257 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4635  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36 
 
 
257 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1169  electron transfer flavoprotein, beta subunit  35.29 
 
 
249 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000191925  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1471  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.1 
 
 
249 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00534232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4651  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36 
 
 
257 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1691  electron transfer flavoprotein subunit beta  35.51 
 
 
253 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2267  electron transfer flavoprotein subunit beta  33.72 
 
 
283 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2242  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.41 
 
 
249 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438561  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0324  electron transfer flavoprotein beta-subunit  35.51 
 
 
253 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171629  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4175  electron transfer flavoprotein subunit beta  35.41 
 
 
249 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00698848  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2153  electron transfer flavoprotein subunit beta  33.33 
 
 
258 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000153596  normal  0.854717 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0217  electron transfer flavoprotein beta subunit  34.43 
 
 
252 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0655  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  32.51 
 
 
259 aa  123  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1021  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.66 
 
 
249 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1333  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.14 
 
 
258 aa  122  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>