More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2342 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  100 
 
 
228 aa  448  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  68.6 
 
 
213 aa  298  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  68.1 
 
 
241 aa  278  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  65.17 
 
 
205 aa  263  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  70.29 
 
 
325 aa  260  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2233  SNARE associated Golgi protein  64.56 
 
 
266 aa  250  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.300911  normal  0.0707133 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2092  hypothetical protein  64.56 
 
 
266 aa  246  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.613654  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  54.73 
 
 
216 aa  238  8e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00380  uncharacterized membrane-associated protein  58.21 
 
 
225 aa  231  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.157749 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  51.39 
 
 
215 aa  221  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  55.5 
 
 
248 aa  204  8e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  51 
 
 
228 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  44.88 
 
 
206 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  44.61 
 
 
201 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  45.41 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  41.92 
 
 
209 aa  174  8e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  47.98 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  43.14 
 
 
205 aa  171  6.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  47.06 
 
 
224 aa  169  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  43.81 
 
 
231 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  47.25 
 
 
198 aa  162  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.44 
 
 
224 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  40.57 
 
 
216 aa  159  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  39.29 
 
 
198 aa  157  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  42.86 
 
 
202 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  44.98 
 
 
217 aa  154  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  43.56 
 
 
205 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  40.11 
 
 
208 aa  152  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  40.74 
 
 
214 aa  151  7e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1525  SNARE associated Golgi protein  49.69 
 
 
228 aa  151  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.365911  hitchhiker  0.00841691 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  42.46 
 
 
211 aa  150  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  43 
 
 
202 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  40 
 
 
215 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  43.2 
 
 
239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  46.19 
 
 
206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36950  uncharacterized membrane-associated protein  38.94 
 
 
241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  43.6 
 
 
202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17501  DedA family alkaline phosphatase-like protein  40.53 
 
 
220 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  43.2 
 
 
206 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  40.39 
 
 
213 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0636  SNARE associated Golgi protein  49.09 
 
 
217 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  42.11 
 
 
202 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  42.35 
 
 
203 aa  142  5e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  39.67 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  37.56 
 
 
208 aa  139  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0103  putative alkaline phosphatase-like protein  40.69 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  43.4 
 
 
218 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0147  putative alkaline phosphatase-like protein  39.25 
 
 
219 aa  138  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629007  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.46 
 
 
207 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  36.5 
 
 
199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  38.95 
 
 
202 aa  129  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  35.47 
 
 
210 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  33.65 
 
 
212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  36.05 
 
 
207 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  36.51 
 
 
199 aa  122  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  32.84 
 
 
212 aa  122  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  36.46 
 
 
203 aa  122  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.05 
 
 
205 aa  122  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  35.9 
 
 
198 aa  121  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1717  DedA family alkaline phosphatase-like protein  35.85 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.25 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  34.65 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  34.3 
 
 
208 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  33.49 
 
 
203 aa  119  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  36.13 
 
 
208 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2536  SNARE associated Golgi protein  34.03 
 
 
203 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2588  SNARE associated Golgi protein  34.03 
 
 
203 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.08 
 
 
203 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  37.04 
 
 
202 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  36.22 
 
 
197 aa  115  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  38.51 
 
 
200 aa  114  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  35.92 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  35.96 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18161  DedA family alkaline phosphatase-like protein  36.02 
 
 
219 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  36.42 
 
 
205 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  32.61 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01771  DedA family alkaline phosphatase-like protein  41.94 
 
 
223 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18341  DedA family alkaline phosphatase-like protein  35.18 
 
 
218 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  35.06 
 
 
201 aa  111  7.000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  31.94 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18131  DedA family alkaline phosphatase-like protein  40.38 
 
 
219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.00672405  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  34.18 
 
 
218 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  33.67 
 
 
218 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  33.67 
 
 
218 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  32.09 
 
 
202 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  35.57 
 
 
201 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  35.57 
 
 
201 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  34.54 
 
 
218 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  38.56 
 
 
202 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  31.37 
 
 
202 aa  107  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  32.94 
 
 
199 aa  106  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  36.24 
 
 
178 aa  105  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  31.71 
 
 
200 aa  105  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  35.05 
 
 
201 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  31.86 
 
 
200 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  31.86 
 
 
200 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  31.86 
 
 
200 aa  105  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  31.86 
 
 
200 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  31.55 
 
 
202 aa  105  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  35.24 
 
 
206 aa  105  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>