More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2283 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2283  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
116 aa  239  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  64.42 
 
 
355 aa  147  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3422  transcriptional regulator, ArsR family  62.5 
 
 
110 aa  144  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636226  normal  0.0872067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0073  ArsR family transcriptional regulator  54.9 
 
 
110 aa  124  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.77483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8615  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
113 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00863901  normal  0.187471 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4493  transcriptional regulator, ArsR family  40.2 
 
 
302 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  45.57 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  43.53 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 
119 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
123 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  43.9 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  43.59 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 
309 aa  64.3  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
349 aa  64.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  47.06 
 
 
120 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  46.27 
 
 
108 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
118 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 
116 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  48.48 
 
 
347 aa  61.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 
116 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  33.94 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  45.59 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 
126 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  41.77 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  42.42 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  42.42 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0179  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
87 aa  58.9  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  40.28 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  40.28 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  40.28 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  40.28 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  40.28 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  38.89 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  40.28 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  38.27 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  41.79 
 
 
306 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
132 aa  57.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  40.28 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 
337 aa  57.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0038  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  40.24 
 
 
336 aa  57.8  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 
131 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 
337 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  40 
 
 
101 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
119 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  36.9 
 
 
119 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26024  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  39.71 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  36.96 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  39.24 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  42.42 
 
 
122 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1060  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
96 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2544  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  35.71 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  36.47 
 
 
119 aa  55.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2855  transcriptional regulator, ArsR family  42.03 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.293533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
103 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  34.57 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1032  transcription regulator, ArsR family  34.29 
 
 
102 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5611  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
103 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1142  transcriptional regulator, ArsR family  31.46 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.629326  normal  0.465859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
130 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  36.62 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 
100 aa  54.7  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  36.62 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>