More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2142 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  100 
 
 
313 aa  607  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  57.45 
 
 
336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  58.67 
 
 
316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  53.42 
 
 
325 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  47.46 
 
 
313 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  47.18 
 
 
308 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0064  1-phosphofructokinase  42.54 
 
 
315 aa  211  9e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596647  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  46.58 
 
 
328 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  44.69 
 
 
333 aa  209  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1536  PfkB domain protein  46.71 
 
 
319 aa  205  9e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.676863  decreased coverage  0.0024307 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0751  ribokinase-like domain-containing protein  42.68 
 
 
328 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2218  1-phosphofructokinase  42.68 
 
 
321 aa  199  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.023683  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0095  ribokinase-like domain-containing protein  43.57 
 
 
325 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0071  ribokinase-like domain-containing protein  44.04 
 
 
325 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.897309  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0081  PfkB  43.73 
 
 
325 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0457404  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  42.77 
 
 
318 aa  192  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0090  ribokinase-like domain-containing protein  43.73 
 
 
325 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2176  1-phosphofructokinase  41.38 
 
 
325 aa  189  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165364  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0300  ribokinase-like domain-containing protein  43.99 
 
 
332 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4851  1-phosphofructokinase  41.99 
 
 
344 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440594  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0185  1-phosphofructokinase  45.08 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0526  1-phosphofructokinase  42.68 
 
 
330 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  33.79 
 
 
306 aa  159  7e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  33.85 
 
 
315 aa  159  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  36.17 
 
 
324 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  35.49 
 
 
303 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  31.46 
 
 
311 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  37.06 
 
 
315 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  32.62 
 
 
310 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  31.74 
 
 
307 aa  155  6e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  34.09 
 
 
311 aa  155  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  38.37 
 
 
312 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  38.37 
 
 
312 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  38.37 
 
 
312 aa  155  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  38.37 
 
 
312 aa  155  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  38.37 
 
 
312 aa  155  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  38.37 
 
 
312 aa  155  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  38.37 
 
 
312 aa  155  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  37.98 
 
 
312 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  36.14 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  38.76 
 
 
312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  37.6 
 
 
312 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  37.6 
 
 
312 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  37.6 
 
 
312 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 
303 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  37.6 
 
 
312 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  37.6 
 
 
312 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  32.79 
 
 
310 aa  152  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  33.67 
 
 
303 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  33.67 
 
 
303 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  33.67 
 
 
303 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  33.67 
 
 
303 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  37.98 
 
 
312 aa  152  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  36.36 
 
 
315 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  35.67 
 
 
303 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  32.76 
 
 
306 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  33.78 
 
 
303 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  32.66 
 
 
310 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2760  1-phosphofructokinase  40.91 
 
 
302 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  37.31 
 
 
312 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  36.43 
 
 
312 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 
303 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  33.78 
 
 
303 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  36.43 
 
 
312 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
309 aa  149  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  32.42 
 
 
306 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  31.25 
 
 
308 aa  149  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  31.99 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  34.01 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  30.16 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  32.79 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  32.99 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  31.7 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  34.87 
 
 
314 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  37.31 
 
 
312 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  37.69 
 
 
313 aa  146  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  39.85 
 
 
327 aa  146  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  35.57 
 
 
319 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  37.31 
 
 
312 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000785688  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  35.57 
 
 
319 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  33.98 
 
 
308 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  36.74 
 
 
314 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  37.31 
 
 
312 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  33.1 
 
 
316 aa  144  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  37.31 
 
 
312 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0744  1-phosphofructokinase  35.11 
 
 
315 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0611075  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  32.87 
 
 
307 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  32.65 
 
 
303 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  28.22 
 
 
305 aa  143  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  30.63 
 
 
311 aa  142  5e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  33.12 
 
 
319 aa  142  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  36.71 
 
 
315 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  32.17 
 
 
313 aa  142  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  33.79 
 
 
303 aa  142  8e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  31.93 
 
 
307 aa  142  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  32.68 
 
 
317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  32.44 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  33.33 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  31.01 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>