More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2050 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2050  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
84 aa  165  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.532396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  74.07 
 
 
101 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  71.6 
 
 
103 aa  124  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13680  transcriptional regulator, ArsR family  70.37 
 
 
139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.55199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  65.43 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1262  transcriptional regulator, ArsR family  66.67 
 
 
133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2744  transcriptional regulator, ArsR family  64.2 
 
 
124 aa  107  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3149  regulatory protein ArsR  65.43 
 
 
164 aa  107  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.605941  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  64.2 
 
 
120 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  64.2 
 
 
120 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  61.73 
 
 
120 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  64.2 
 
 
120 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  62.96 
 
 
131 aa  104  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  42.17 
 
 
104 aa  74.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2471  regulatory protein ArsR  43.21 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.411264  normal  0.730529 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1371  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  36.99 
 
 
87 aa  70.5  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  46.88 
 
 
102 aa  67  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1149  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 
125 aa  67  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161631  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1139  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.485889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1143  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214185  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
102 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  46.88 
 
 
102 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  48.39 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  42.86 
 
 
118 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  41.27 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  36.99 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  46.88 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4069  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 
115 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  33.33 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  35.8 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  35.8 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  36 
 
 
98 aa  60.8  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  41.67 
 
 
110 aa  60.8  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  33.33 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4223  regulatory protein, ArsR  36.99 
 
 
98 aa  60.5  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
117 aa  60.1  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  34.57 
 
 
125 aa  60.1  0.000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  44.87 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5567  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3227  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3201  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00511684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3134  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.339641  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0723  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3479  ArsR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3442  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0562  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1714  ArsR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.515787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3457  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1797  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00267488  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0487  ArsR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
99 aa  58.9  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 
141 aa  58.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4161  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
172 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0906669  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  39.19 
 
 
115 aa  58.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4483  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
172 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3430  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 
91 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3921  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0529731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  39.73 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4000  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
100 aa  57.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4010  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
100 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1816  transcriptional regulator, ArsR family  41.89 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98028  normal  0.175921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  39.19 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4279  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4339  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  37.97 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  35 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0357  transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.175794 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  35 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4112  ArsR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  39.19 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  35 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4392  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0861  transcriptional regulator, ArsR family  41.1 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>