31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1998 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1998  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  915    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101502  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3715  hypothetical protein  45.43 
 
 
460 aa  309  6.999999999999999e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000995808  normal  0.471663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2422  hypothetical protein  34.09 
 
 
510 aa  176  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0414042  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4484  hypothetical protein  31.93 
 
 
447 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8777  transcriptional regulator  30 
 
 
469 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1224  regulator  31.41 
 
 
453 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483288  normal  0.967223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8297  hypothetical protein  31.49 
 
 
452 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1107  hypothetical protein  28.7 
 
 
468 aa  87  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3968  hypothetical protein  28.66 
 
 
457 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0256959  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2889  putative DNA-binding protein  32.34 
 
 
477 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0241549  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7319  putative DNA-binding protein  30.51 
 
 
432 aa  80.1  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000491826  decreased coverage  0.00000000376274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1073  hypothetical protein  30.41 
 
 
579 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542041  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3660  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 
463 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4805  hypothetical protein  28.16 
 
 
478 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  normal  0.646806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8001  hypothetical protein  26.67 
 
 
487 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2899  hypothetical protein  36.43 
 
 
467 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285709  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1959  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 
461 aa  63.5  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2377  hypothetical protein  29.89 
 
 
437 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  33.06 
 
 
401 aa  60.1  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3334  hypothetical protein  29.12 
 
 
524 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176126  hitchhiker  0.000765121 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3448  hypothetical protein  27.02 
 
 
413 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3947  hypothetical protein  40.24 
 
 
146 aa  57  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1195  putative transcriptional regulator  25 
 
 
441 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6151  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 
449 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764047  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07960  Helix-turn-helix protein  26.67 
 
 
444 aa  53.9  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  28.19 
 
 
526 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5136  XRE family transcriptional regulator  34.23 
 
 
488 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.033803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0466  tetratricopeptide TPR_2  28.93 
 
 
449 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.924549  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14230  hypothetical protein  27.57 
 
 
433 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413871  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  23.1 
 
 
456 aa  44.3  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0895  putative DNA-binding protein  28.7 
 
 
503 aa  43.5  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>