More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1970 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
492 aa  997    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  63.24 
 
 
504 aa  630  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  61.9 
 
 
493 aa  616  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18620  glutamyl-tRNA synthetase  58.57 
 
 
509 aa  613  9.999999999999999e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2263  glutamyl-tRNA synthetase  58.76 
 
 
504 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000271542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2133  glutamyl-tRNA synthetase  62.01 
 
 
495 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  59.1 
 
 
509 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1688  glutamyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 
505 aa  604  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  60.04 
 
 
491 aa  599  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  60 
 
 
512 aa  599  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3218  glutamyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 
494 aa  597  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.464884  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  60.74 
 
 
490 aa  595  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  60.74 
 
 
490 aa  595  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1356  glutamyl-tRNA synthetase  59.47 
 
 
501 aa  592  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556495  normal  0.576333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  58.56 
 
 
504 aa  591  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  60.74 
 
 
490 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1202  glutamyl-tRNA synthetase  59.72 
 
 
503 aa  585  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461842  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10720  glutamyl-tRNA synthetase  57.11 
 
 
532 aa  583  1.0000000000000001e-165  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0971549  normal  0.479795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  61.57 
 
 
496 aa  582  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13007  glutamyl-tRNA synthetase  60.94 
 
 
490 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196997  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  60.29 
 
 
501 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  58.46 
 
 
499 aa  579  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08640  glutamyl-tRNA synthetase  59.01 
 
 
525 aa  559  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  55.49 
 
 
491 aa  559  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0201  glutamate--tRNA ligase  53.46 
 
 
517 aa  553  1e-156  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1261  glutamyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 
506 aa  554  1e-156  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 
494 aa  528  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
504 aa  397  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
490 aa  358  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 
482 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
485 aa  345  8e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
471 aa  344  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 
488 aa  344  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 
485 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 
484 aa  340  4e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 
477 aa  340  4e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 
491 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
501 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
486 aa  336  5e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
494 aa  335  7.999999999999999e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
468 aa  335  7.999999999999999e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 
504 aa  333  5e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  36.64 
 
 
495 aa  331  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
500 aa  331  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2805  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
455 aa  330  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
470 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 
487 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 
472 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
484 aa  326  6e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 
479 aa  325  9e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
484 aa  324  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
468 aa  325  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
492 aa  323  3e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8025  glutamyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
455 aa  324  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0181  glutamyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
481 aa  323  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 
467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
490 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3615  glutamyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 
469 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741076  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1528  glutamyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
468 aa  318  2e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
491 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 
484 aa  317  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 
484 aa  317  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
466 aa  317  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
466 aa  317  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 
498 aa  316  6e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
488 aa  316  8e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
503 aa  315  8e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 
506 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
492 aa  315  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
505 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 
506 aa  314  1.9999999999999998e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
490 aa  314  1.9999999999999998e-84  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 
485 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
469 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
467 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3375  glutamyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 
465 aa  310  5e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
471 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
491 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 
463 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 
469 aa  309  8e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 
467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
485 aa  307  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 
475 aa  307  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 
495 aa  307  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
507 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
475 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 
469 aa  306  6e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0623  glutamyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.122003  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 
478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
495 aa  305  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
488 aa  305  2.0000000000000002e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 
493 aa  304  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>