More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1931 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  100 
 
 
490 aa  977    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.65 
 
 
484 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.29 
 
 
490 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  49.19 
 
 
492 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1199  glycoside hydrolase family 3 protein  51.14 
 
 
483 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  45 
 
 
503 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  45.36 
 
 
499 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.72 
 
 
504 aa  346  6e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  45.31 
 
 
498 aa  343  5e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  42.8 
 
 
520 aa  325  8.000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  44.24 
 
 
468 aa  301  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.25 
 
 
482 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.35 
 
 
594 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.02 
 
 
530 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0128  glycoside hydrolase family 3 protein  41.69 
 
 
475 aa  248  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.174382  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  42.16 
 
 
511 aa  223  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25420  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  42.17 
 
 
519 aa  223  8e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.128783  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.82 
 
 
511 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.66 
 
 
528 aa  221  3e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.52 
 
 
698 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.04 
 
 
543 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  41.07 
 
 
365 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.01 
 
 
365 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.01 
 
 
365 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  42.03 
 
 
517 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  37.26 
 
 
845 aa  206  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  28.93 
 
 
520 aa  201  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  41.5 
 
 
656 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  41.43 
 
 
631 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  40.45 
 
 
420 aa  196  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  40.07 
 
 
427 aa  196  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  38.32 
 
 
552 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  35.19 
 
 
633 aa  194  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  40.45 
 
 
365 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.02 
 
 
543 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  37.16 
 
 
444 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  30.89 
 
 
990 aa  192  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.21 
 
 
398 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  41.06 
 
 
604 aa  189  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  38.25 
 
 
557 aa  184  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.11 
 
 
426 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  36.77 
 
 
699 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.53 
 
 
976 aa  185  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  32.61 
 
 
966 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  37.08 
 
 
699 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.32 
 
 
582 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  37.08 
 
 
699 aa  183  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  36.49 
 
 
699 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.32 
 
 
591 aa  181  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.76 
 
 
558 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  36.05 
 
 
543 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.75 
 
 
596 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.54 
 
 
600 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  33.44 
 
 
363 aa  181  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  34.74 
 
 
350 aa  179  1e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.46 
 
 
375 aa  179  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  35.95 
 
 
589 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  35.44 
 
 
361 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  37.14 
 
 
971 aa  178  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  31.33 
 
 
618 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  35.17 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.08 
 
 
478 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  38.12 
 
 
734 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  33.63 
 
 
673 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  36.54 
 
 
585 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  36.15 
 
 
370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.79 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  40.82 
 
 
575 aa  173  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  37.83 
 
 
592 aa  172  9e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.6 
 
 
573 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.96 
 
 
580 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  35.17 
 
 
541 aa  170  7e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.32 
 
 
373 aa  169  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22490  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.11 
 
 
412 aa  169  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.796827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  35.06 
 
 
637 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  39.13 
 
 
1003 aa  166  5.9999999999999996e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.58 
 
 
395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  40.48 
 
 
575 aa  166  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  38.43 
 
 
538 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  35.1 
 
 
992 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.61 
 
 
365 aa  163  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  37.4 
 
 
336 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.67 
 
 
534 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  35.09 
 
 
997 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.67 
 
 
534 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  33.13 
 
 
352 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.26 
 
 
392 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.83 
 
 
375 aa  162  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.42 
 
 
364 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.29 
 
 
583 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  37.01 
 
 
336 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.41 
 
 
387 aa  160  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2414  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.74 
 
 
373 aa  160  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.77 
 
 
1018 aa  160  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.93 
 
 
379 aa  159  9e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0777  glycosy hydrolase family protein  30.79 
 
 
354 aa  159  9e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.696982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.76 
 
 
537 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0117  glycoside hydrolase family 3 protein  30.79 
 
 
465 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.1 
 
 
953 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  36.61 
 
 
336 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>