54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1900 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  100 
 
 		 504 aa  1008    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  52.55 
 
 		 518 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  43.97 
 
 		 543 aa  355  6.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  37.25 
 
 		 1029 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  36.43 
 
 		 566 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  28.43 
 
 		 1332 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  31.11 
 
 		 580 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  31.3 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  32.37 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  31.28 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  28.22 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.95 
 
 		 12684 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  28.77 
 
 		 279 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  32.09 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  39.66 
 
 		 301 aa  57  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  29.33 
 
 		 834 aa  57.4  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  28.64 
 
 		 246 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1011 aa  55.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  28.65 
 
 		 1050 aa  55.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 669 aa  55.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  30.87 
 
 		 298 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  29.21 
 
 		 259 aa  54.3  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  27.78 
 
 		 870 aa  53.5  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 379 aa  53.5  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  28.5 
 
 		 701 aa  53.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  25.36 
 
 		 885 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  37.69 
 
 		 276 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1406 aa  50.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  29.63 
 
 		 256 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1607  hypothetical protein  25.97 
 
 		 826 aa  50.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0443973  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  30.52 
 
 		 272 aa  50.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  32.81 
 
 		 297 aa  50.1  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  27.4 
 
 		 253 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  28.86 
 
 		 253 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  31.56 
 
 		 239 aa  49.3  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  30.39 
 
 		 275 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  31.52 
 
 		 294 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  29.94 
 
 		 710 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  31.28 
 
 		 277 aa  47.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  31.08 
 
 		 256 aa  47  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  28.77 
 
 		 249 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  31.4 
 
 		 254 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  32.81 
 
 		 278 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 659 aa  45.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  33.61 
 
 		 276 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4807  hypothetical protein  52.94 
 
 		 450 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.280649  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  27.16 
 
 		 253 aa  44.3  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  31.16 
 
 		 283 aa  43.9  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1157  hypothetical protein  34.78 
 
 		 324 aa  43.9  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.109349  hitchhiker  0.00127607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  47.17 
 
 		 249 aa  43.9  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  37.42 
 
 		 246 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  37.42 
 
 		 246 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  37.42 
 
 		 246 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>