More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1875 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 921 aa  1808    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  42.49 
 
 		 930 aa  607  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  41.08 
 
 		 907 aa  562  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  43.29 
 
 		 928 aa  548  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  41.82 
 
 		 919 aa  548  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  37.13 
 
 		 965 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  37 
 
 		 908 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  39.12 
 
 		 806 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  33.96 
 
 		 946 aa  406  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  34.27 
 
 		 967 aa  399  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  34.82 
 
 		 970 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  36.7 
 
 		 1025 aa  395  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  36.7 
 
 		 931 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  36.1 
 
 		 940 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  35.19 
 
 		 956 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  38.07 
 
 		 814 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  34.99 
 
 		 928 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  36.64 
 
 		 757 aa  364  4e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  34.55 
 
 		 1030 aa  363  7.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  41.26 
 
 		 1010 aa  360  9e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  33.76 
 
 		 941 aa  360  9e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  37.65 
 
 		 838 aa  355  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  34.15 
 
 		 964 aa  349  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  40.95 
 
 		 1014 aa  348  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.48 
 
 		 921 aa  348  3e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  38.28 
 
 		 1027 aa  345  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.45 
 
 		 742 aa  342  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  34.01 
 
 		 937 aa  340  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 1048 aa  338  3.9999999999999995e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 1071 aa  337  5e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  33.98 
 
 		 990 aa  335  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  34.53 
 
 		 1088 aa  332  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  34.3 
 
 		 1011 aa  331  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  31.88 
 
 		 1022 aa  330  8e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  32.08 
 
 		 1017 aa  328  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  33.26 
 
 		 1054 aa  328  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  36.2 
 
 		 993 aa  327  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  39.49 
 
 		 1003 aa  328  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  32.67 
 
 		 992 aa  328  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  32.59 
 
 		 1020 aa  326  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  41.86 
 
 		 1001 aa  325  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  33.5 
 
 		 993 aa  324  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  36.7 
 
 		 1030 aa  322  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 995 aa  317  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  31.7 
 
 		 962 aa  316  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  38.66 
 
 		 1033 aa  311  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  34.25 
 
 		 990 aa  311  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  32.16 
 
 		 981 aa  310  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  33.52 
 
 		 965 aa  310  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  31.31 
 
 		 982 aa  308  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  32.52 
 
 		 996 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  34.14 
 
 		 1003 aa  300  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  32.43 
 
 		 1008 aa  295  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  35.33 
 
 		 983 aa  293  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  31.37 
 
 		 934 aa  291  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  33.92 
 
 		 992 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  33.08 
 
 		 935 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  30.75 
 
 		 1108 aa  283  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  30.5 
 
 		 913 aa  281  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  33.37 
 
 		 950 aa  280  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  37.03 
 
 		 775 aa  278  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  36.82 
 
 		 1003 aa  273  8.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  32.65 
 
 		 954 aa  272  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  30.7 
 
 		 1022 aa  272  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  31.75 
 
 		 1034 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  35.16 
 
 		 981 aa  270  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  31.97 
 
 		 971 aa  270  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  34.7 
 
 		 915 aa  268  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  35.52 
 
 		 963 aa  262  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  37.66 
 
 		 926 aa  262  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  30.87 
 
 		 1013 aa  257  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  31.93 
 
 		 1025 aa  256  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  34.52 
 
 		 788 aa  256  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 654 aa  253  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  39.19 
 
 		 496 aa  253  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  31.52 
 
 		 978 aa  251  5e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  32.85 
 
 		 1004 aa  250  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  30.28 
 
 		 1021 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  37.16 
 
 		 952 aa  243  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  32.01 
 
 		 850 aa  239  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  33.76 
 
 		 790 aa  235  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  33.72 
 
 		 621 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  37.95 
 
 		 915 aa  233  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  35.91 
 
 		 910 aa  229  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  34.23 
 
 		 989 aa  228  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 		 755 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  35.1 
 
 		 910 aa  223  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  33.65 
 
 		 797 aa  222  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4985  Tetratricopeptide TPR_4  33.74 
 
 		 687 aa  221  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.688243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  35.6 
 
 		 582 aa  221  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  34.32 
 
 		 1138 aa  221  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  37.95 
 
 		 453 aa  218  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  34.2 
 
 		 775 aa  218  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  34.54 
 
 		 612 aa  212  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 622 aa  210  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  34.26 
 
 		 632 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  31.03 
 
 		 1024 aa  207  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 1319 aa  206  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  27.24 
 
 		 1033 aa  205  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  30.85 
 
 		 783 aa  204  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>