86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1779 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  51.06 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  38.66 
 
 		 230 aa  121  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  37.43 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  38.97 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  36.42 
 
 		 224 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  39.55 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 225 aa  95.5  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  38.01 
 
 		 193 aa  92  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  37.13 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  36.81 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  39.77 
 
 		 213 aa  88.2  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  33.85 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  35.37 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.2 
 
 		 243 aa  86.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  35.98 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  36.31 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  56.41 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  34.97 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  33.52 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  37.66 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  41.06 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  36.42 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  41.59 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.99 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  39.74 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  30.61 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  30.68 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  33.99 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  45.07 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  43.48 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  31.85 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2627  ArsR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 102 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.8267  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05590  hypothetical protein  33.91 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604639  normal  0.83451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  41.94 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2808  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 		 101 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.598578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2713  transcriptional regulator, ArsR family  45.95 
 
 		 102 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2987  regulatory protein, ArsR  26.8 
 
 		 109 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 		 106 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1102  transcriptional regulator, ArsR family  24.18 
 
 		 304 aa  46.2  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  38.36 
 
 		 129 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 129 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 194 aa  44.7  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 110 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  30.85 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 		 109 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 100 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 111 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  25.26 
 
 		 107 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 95 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 		 95 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  39.71 
 
 		 102 aa  43.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 95 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  35.19 
 
 		 104 aa  42.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 95 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2592  regulatory protein ArsR  38.64 
 
 		 123 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.108396 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 95 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 95 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2815  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 169 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.897524  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1513  ArsR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 108 aa  43.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.313082  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 95 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  25.26 
 
 		 107 aa  42.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 112 aa  42.7  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  31.52 
 
 		 95 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 		 108 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  36.99 
 
 		 114 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0148  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 91 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0006  regulatory protein, ArsR  40.62 
 
 		 98 aa  42  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  19.77 
 
 		 188 aa  42  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 		 222 aa  42  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2895  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 322 aa  41.6  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0512058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 162 aa  41.6  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2260  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 183 aa  41.6  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.1059  normal  0.463419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 110 aa  41.2  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  38.57 
 
 		 113 aa  41.2  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  30.43 
 
 		 95 aa  41.2  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  39.71 
 
 		 107 aa  41.2  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>