More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1739 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  100 
 
 		 392 aa  770    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5618  Signal transduction histidine kinase-like protein  53.69 
 
 		 431 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  45.89 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2086  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.43 
 
 		 389 aa  213  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  37.8 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  36.09 
 
 		 400 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  46.12 
 
 		 462 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  38.31 
 
 		 367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  37.89 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 420 aa  179  8e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 441 aa  179  9e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  38.92 
 
 		 399 aa  179  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  35.56 
 
 		 447 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  37.39 
 
 		 442 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  37.09 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  35.47 
 
 		 408 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  36.98 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  41.56 
 
 		 433 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 405 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  46.8 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  35.77 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  33.51 
 
 		 381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 394 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  48.02 
 
 		 372 aa  163  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  37.46 
 
 		 380 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  39.75 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  34.87 
 
 		 422 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  41.07 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  38.61 
 
 		 428 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  34.8 
 
 		 380 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 403 aa  159  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  34.15 
 
 		 430 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 496 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 441 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.78 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.8 
 
 		 370 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  33.42 
 
 		 402 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  45.66 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.94 
 
 		 401 aa  153  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.9 
 
 		 430 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  35.84 
 
 		 417 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  36.8 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  39.11 
 
 		 478 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  44.44 
 
 		 457 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.78 
 
 		 378 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  42.67 
 
 		 442 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  37.16 
 
 		 395 aa  150  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  33.82 
 
 		 378 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  34.44 
 
 		 375 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.03 
 
 		 400 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0309  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 400 aa  149  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  37.28 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 469 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  40.98 
 
 		 423 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  38.26 
 
 		 408 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 387 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  37.71 
 
 		 438 aa  146  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  38.23 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.08 
 
 		 386 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  40.35 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.93 
 
 		 443 aa  143  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.08 
 
 		 370 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 500 aa  143  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 		 379 aa  143  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  41.06 
 
 		 369 aa  143  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  34.82 
 
 		 384 aa  143  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  42.25 
 
 		 379 aa  143  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 		 445 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  42.53 
 
 		 443 aa  142  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  34.2 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  41.53 
 
 		 399 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  37.98 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  41.42 
 
 		 419 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2823  histidine kinase  33.15 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302112  normal  0.674587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.54 
 
 		 380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 467 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.5 
 
 		 271 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  40.97 
 
 		 372 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 420 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  34.51 
 
 		 395 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2556  histidine kinase  37.54 
 
 		 416 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.62 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  38.26 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.26 
 
 		 424 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 424 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  31.38 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7811  histidine kinase  38.58 
 
 		 291 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0540  histidine kinase  34.06 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.15 
 
 		 422 aa  133  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0103  histidine kinase  41.86 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>